Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RBBP8Q99708 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RBBP8Q99708 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
RBBP8Q99708 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RBBP8Q99708 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RBBP8Q99708 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RBBP8Q99708 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RBBP8Q99708 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RBBP8Q99708 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RBBP8Q99708 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RBBP8Q99708 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RBBP8Q99708 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RBBP8Q99708 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RBBP8Q99708 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RBBP8Q99708 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RBBP8Q99708 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RBBP8Q99708 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RBBP8Q99708 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RBBP8Q99708 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RBBP8Q99708 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RBBP8Q99708 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RBBP8Q99708 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RBBP8Q99708 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RBBP8Q99708 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RBBP8Q99708 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RBBP8Q99708 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RBBP8Q99708 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RBBP8Q99708 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RBBP8Q99708 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RBBP8Q99708 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
RBBP8Q99708 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RBBP8Q99708 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
RBBP8Q99708 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RBBP8Q99708 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RBBP8Q99708 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RBBP8Q99708 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RBBP8Q99708 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RBBP8Q99708 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RBBP8Q99708 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RBBP8Q99708 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RBBP8Q99708 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RBBP8Q99708 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RBBP8Q99708 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RBBP8Q99708 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RBBP8Q99708 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RBBP8Q99708 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RBBP8Q99708 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RBBP8Q99708 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
RBBP8Q99708 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RBBP8Q99708 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RBBP8Q99708 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RBBP8Q99708 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RBBP8Q99708 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RBBP8Q99708 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RBBP8Q99708 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RBBP8Q99708 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RBBP8Q99708 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RBBP8Q99708 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
RBBP8Q99708 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RBBP8Q99708 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RBBP8Q99708 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RBBP8Q99708 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RBBP8Q99708 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
RBBP8Q99708 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RBBP8Q99708 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RBBP8Q99708 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
RBBP8Q99708 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RBBP8Q99708 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
RBBP8Q99708 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RBBP8Q99708 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RBBP8Q99708 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
RBBP8Q99708 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
RBBP8Q99708 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RBBP8Q99708 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
RBBP8Q99708 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RBBP8Q99708 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
RBBP8Q99708 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
RBBP8Q99708 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RBBP8Q99708 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RBBP8Q99708 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RBBP8Q99708 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RBBP8Q99708 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RBBP8Q99708 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RBBP8Q99708 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RBBP8Q99708 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RBBP8Q99708 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RBBP8Q99708 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RBBP8Q99708 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RBBP8Q99708 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RBBP8Q99708 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RBBP8Q99708 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RBBP8Q99708 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RBBP8Q99708 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RBBP8Q99708 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
RBBP8Q99708 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RBBP8Q99708 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
RBBP8Q99708 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
RBBP8Q99708 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RBBP8Q99708 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
RBBP8Q99708 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms