Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q15

SMG1, Serine/threonine-protein kinase SMG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,661 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1Q96Q15 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SMG1Q96Q15 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMG1Q96Q15 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMG1Q96Q15 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMG1Q96Q15 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMG1Q96Q15 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMG1Q96Q15 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMG1Q96Q15 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMG1Q96Q15 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMG1Q96Q15 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMG1Q96Q15 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMG1Q96Q15 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMG1Q96Q15 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMG1Q96Q15 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMG1Q96Q15 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMG1Q96Q15 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SMG1Q96Q15 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMG1Q96Q15 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMG1Q96Q15 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMG1Q96Q15 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMG1Q96Q15 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMG1Q96Q15 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMG1Q96Q15 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMG1Q96Q15 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMG1Q96Q15 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMG1Q96Q15 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMG1Q96Q15 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMG1Q96Q15 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMG1Q96Q15 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMG1Q96Q15 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMG1Q96Q15 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMG1Q96Q15 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
SMG1Q96Q15 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMG1Q96Q15 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMG1Q96Q15 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMG1Q96Q15 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMG1Q96Q15 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMG1Q96Q15 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMG1Q96Q15 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMG1Q96Q15 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
SMG1Q96Q15 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMG1Q96Q15 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMG1Q96Q15 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMG1Q96Q15 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMG1Q96Q15 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMG1Q96Q15 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
SMG1Q96Q15 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMG1Q96Q15 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMG1Q96Q15 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMG1Q96Q15 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMG1Q96Q15 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMG1Q96Q15 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMG1Q96Q15 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMG1Q96Q15 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
SMG1Q96Q15 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
SMG1Q96Q15 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SMG1Q96Q15 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SMG1Q96Q15 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SMG1Q96Q15 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SMG1Q96Q15 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SMG1Q96Q15 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SMG1Q96Q15 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SMG1Q96Q15 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SMG1Q96Q15 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SMG1Q96Q15 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SMG1Q96Q15 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SMG1Q96Q15 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SMG1Q96Q15 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SMG1Q96Q15 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SMG1Q96Q15 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SMG1Q96Q15 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SMG1Q96Q15 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SMG1Q96Q15 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMG1Q96Q15 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMG1Q96Q15 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMG1Q96Q15 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMG1Q96Q15 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMG1Q96Q15 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMG1Q96Q15 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMG1Q96Q15 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMG1Q96Q15 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMG1Q96Q15 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMG1Q96Q15 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMG1Q96Q15 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMG1Q96Q15 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMG1Q96Q15 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMG1Q96Q15 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMG1Q96Q15 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMG1Q96Q15 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMG1Q96Q15 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMG1Q96Q15 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMG1Q96Q15 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMG1Q96Q15 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMG1Q96Q15 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMG1Q96Q15 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMG1Q96Q15 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SMG1Q96Q15 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMG1Q96Q15 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMG1Q96Q15 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMG1Q96Q15 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
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