Protein–RNA interactions for Protein: Q96LX7

CCDC17, Coiled-coil domain-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC17Q96LX7 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC17Q96LX7 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC17Q96LX7 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC17Q96LX7 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC17Q96LX7 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC17Q96LX7 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC17Q96LX7 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC17Q96LX7 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC17Q96LX7 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC17Q96LX7 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC17Q96LX7 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC17Q96LX7 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC17Q96LX7 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC17Q96LX7 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC17Q96LX7 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC17Q96LX7 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC17Q96LX7 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC17Q96LX7 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC17Q96LX7 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC17Q96LX7 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC17Q96LX7 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC17Q96LX7 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC17Q96LX7 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC17Q96LX7 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC17Q96LX7 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC17Q96LX7 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC17Q96LX7 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC17Q96LX7 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC17Q96LX7 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC17Q96LX7 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC17Q96LX7 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC17Q96LX7 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC17Q96LX7 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC17Q96LX7 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC17Q96LX7 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC17Q96LX7 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC17Q96LX7 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC17Q96LX7 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC17Q96LX7 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC17Q96LX7 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC17Q96LX7 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC17Q96LX7 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC17Q96LX7 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC17Q96LX7 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC17Q96LX7 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC17Q96LX7 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC17Q96LX7 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC17Q96LX7 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC17Q96LX7 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC17Q96LX7 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC17Q96LX7 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC17Q96LX7 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC17Q96LX7 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC17Q96LX7 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC17Q96LX7 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC17Q96LX7 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC17Q96LX7 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC17Q96LX7 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC17Q96LX7 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC17Q96LX7 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC17Q96LX7 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC17Q96LX7 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC17Q96LX7 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC17Q96LX7 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC17Q96LX7 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC17Q96LX7 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC17Q96LX7 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC17Q96LX7 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC17Q96LX7 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC17Q96LX7 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC17Q96LX7 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC17Q96LX7 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC17Q96LX7 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC17Q96LX7 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC17Q96LX7 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC17Q96LX7 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC17Q96LX7 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC17Q96LX7 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC17Q96LX7 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC17Q96LX7 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC17Q96LX7 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC17Q96LX7 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC17Q96LX7 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC17Q96LX7 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC17Q96LX7 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC17Q96LX7 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC17Q96LX7 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC17Q96LX7 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC17Q96LX7 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC17Q96LX7 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC17Q96LX7 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC17Q96LX7 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC17Q96LX7 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC17Q96LX7 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC17Q96LX7 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC17Q96LX7 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC17Q96LX7 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC17Q96LX7 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC17Q96LX7 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC17Q96LX7 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms