Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SGCZQ96LD1 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SGCZQ96LD1 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SGCZQ96LD1 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SGCZQ96LD1 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SGCZQ96LD1 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SGCZQ96LD1 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SGCZQ96LD1 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SGCZQ96LD1 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SGCZQ96LD1 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SGCZQ96LD1 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SGCZQ96LD1 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SGCZQ96LD1 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SGCZQ96LD1 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SGCZQ96LD1 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SGCZQ96LD1 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SGCZQ96LD1 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SGCZQ96LD1 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SGCZQ96LD1 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SGCZQ96LD1 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SGCZQ96LD1 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SGCZQ96LD1 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SGCZQ96LD1 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SGCZQ96LD1 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SGCZQ96LD1 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SGCZQ96LD1 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SGCZQ96LD1 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SGCZQ96LD1 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SGCZQ96LD1 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SGCZQ96LD1 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SGCZQ96LD1 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SGCZQ96LD1 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SGCZQ96LD1 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SGCZQ96LD1 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SGCZQ96LD1 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SGCZQ96LD1 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SGCZQ96LD1 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SGCZQ96LD1 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SGCZQ96LD1 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SGCZQ96LD1 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SGCZQ96LD1 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SGCZQ96LD1 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SGCZQ96LD1 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SGCZQ96LD1 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SGCZQ96LD1 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SGCZQ96LD1 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SGCZQ96LD1 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SGCZQ96LD1 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SGCZQ96LD1 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SGCZQ96LD1 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SGCZQ96LD1 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SGCZQ96LD1 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SGCZQ96LD1 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SGCZQ96LD1 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SGCZQ96LD1 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SGCZQ96LD1 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SGCZQ96LD1 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SGCZQ96LD1 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SGCZQ96LD1 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SGCZQ96LD1 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SGCZQ96LD1 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SGCZQ96LD1 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SGCZQ96LD1 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SGCZQ96LD1 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SGCZQ96LD1 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SGCZQ96LD1 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SGCZQ96LD1 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SGCZQ96LD1 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SGCZQ96LD1 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SGCZQ96LD1 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SGCZQ96LD1 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SGCZQ96LD1 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SGCZQ96LD1 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SGCZQ96LD1 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SGCZQ96LD1 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SGCZQ96LD1 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SGCZQ96LD1 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SGCZQ96LD1 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SGCZQ96LD1 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SGCZQ96LD1 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SGCZQ96LD1 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SGCZQ96LD1 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SGCZQ96LD1 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SGCZQ96LD1 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SGCZQ96LD1 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SGCZQ96LD1 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SGCZQ96LD1 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SGCZQ96LD1 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SGCZQ96LD1 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SGCZQ96LD1 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SGCZQ96LD1 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SGCZQ96LD1 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SGCZQ96LD1 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SGCZQ96LD1 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SGCZQ96LD1 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SGCZQ96LD1 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SGCZQ96LD1 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SGCZQ96LD1 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SGCZQ96LD1 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SGCZQ96LD1 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
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