Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ5

MS4A4A, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4A, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A4AQ96JQ5 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MS4A4AQ96JQ5 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MS4A4AQ96JQ5 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MS4A4AQ96JQ5 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MS4A4AQ96JQ5 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MS4A4AQ96JQ5 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MS4A4AQ96JQ5 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MS4A4AQ96JQ5 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MS4A4AQ96JQ5 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MS4A4AQ96JQ5 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
MS4A4AQ96JQ5 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MS4A4AQ96JQ5 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MS4A4AQ96JQ5 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MS4A4AQ96JQ5 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MS4A4AQ96JQ5 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MS4A4AQ96JQ5 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MS4A4AQ96JQ5 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MS4A4AQ96JQ5 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MS4A4AQ96JQ5 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MS4A4AQ96JQ5 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MS4A4AQ96JQ5 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MS4A4AQ96JQ5 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MS4A4AQ96JQ5 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MS4A4AQ96JQ5 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MS4A4AQ96JQ5 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MS4A4AQ96JQ5 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MS4A4AQ96JQ5 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MS4A4AQ96JQ5 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
MS4A4AQ96JQ5 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MS4A4AQ96JQ5 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MS4A4AQ96JQ5 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MS4A4AQ96JQ5 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MS4A4AQ96JQ5 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MS4A4AQ96JQ5 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MS4A4AQ96JQ5 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MS4A4AQ96JQ5 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MS4A4AQ96JQ5 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MS4A4AQ96JQ5 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MS4A4AQ96JQ5 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MS4A4AQ96JQ5 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MS4A4AQ96JQ5 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MS4A4AQ96JQ5 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MS4A4AQ96JQ5 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MS4A4AQ96JQ5 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MS4A4AQ96JQ5 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MS4A4AQ96JQ5 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MS4A4AQ96JQ5 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MS4A4AQ96JQ5 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
MS4A4AQ96JQ5 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MS4A4AQ96JQ5 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
MS4A4AQ96JQ5 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
MS4A4AQ96JQ5 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MS4A4AQ96JQ5 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MS4A4AQ96JQ5 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
MS4A4AQ96JQ5 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MS4A4AQ96JQ5 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MS4A4AQ96JQ5 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MS4A4AQ96JQ5 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MS4A4AQ96JQ5 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MS4A4AQ96JQ5 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MS4A4AQ96JQ5 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MS4A4AQ96JQ5 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MS4A4AQ96JQ5 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MS4A4AQ96JQ5 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MS4A4AQ96JQ5 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MS4A4AQ96JQ5 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MS4A4AQ96JQ5 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MS4A4AQ96JQ5 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MS4A4AQ96JQ5 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MS4A4AQ96JQ5 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
MS4A4AQ96JQ5 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MS4A4AQ96JQ5 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MS4A4AQ96JQ5 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MS4A4AQ96JQ5 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
MS4A4AQ96JQ5 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MS4A4AQ96JQ5 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MS4A4AQ96JQ5 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MS4A4AQ96JQ5 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MS4A4AQ96JQ5 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MS4A4AQ96JQ5 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MS4A4AQ96JQ5 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MS4A4AQ96JQ5 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MS4A4AQ96JQ5 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MS4A4AQ96JQ5 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MS4A4AQ96JQ5 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MS4A4AQ96JQ5 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MS4A4AQ96JQ5 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MS4A4AQ96JQ5 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
MS4A4AQ96JQ5 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MS4A4AQ96JQ5 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MS4A4AQ96JQ5 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MS4A4AQ96JQ5 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MS4A4AQ96JQ5 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MS4A4AQ96JQ5 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MS4A4AQ96JQ5 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MS4A4AQ96JQ5 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MS4A4AQ96JQ5 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
MS4A4AQ96JQ5 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MS4A4AQ96JQ5 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MS4A4AQ96JQ5 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms