Protein–RNA interactions for Protein: Q96AG4

LRRC59, Leucine-rich repeat-containing protein 59, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC59Q96AG4 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LRRC59Q96AG4 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LRRC59Q96AG4 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LRRC59Q96AG4 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LRRC59Q96AG4 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
LRRC59Q96AG4 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
LRRC59Q96AG4 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LRRC59Q96AG4 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
LRRC59Q96AG4 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LRRC59Q96AG4 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LRRC59Q96AG4 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LRRC59Q96AG4 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LRRC59Q96AG4 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LRRC59Q96AG4 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
LRRC59Q96AG4 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LRRC59Q96AG4 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LRRC59Q96AG4 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LRRC59Q96AG4 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LRRC59Q96AG4 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LRRC59Q96AG4 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LRRC59Q96AG4 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LRRC59Q96AG4 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LRRC59Q96AG4 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LRRC59Q96AG4 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LRRC59Q96AG4 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
LRRC59Q96AG4 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LRRC59Q96AG4 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LRRC59Q96AG4 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LRRC59Q96AG4 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LRRC59Q96AG4 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LRRC59Q96AG4 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LRRC59Q96AG4 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LRRC59Q96AG4 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LRRC59Q96AG4 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LRRC59Q96AG4 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LRRC59Q96AG4 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LRRC59Q96AG4 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LRRC59Q96AG4 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LRRC59Q96AG4 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LRRC59Q96AG4 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
LRRC59Q96AG4 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
LRRC59Q96AG4 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
LRRC59Q96AG4 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LRRC59Q96AG4 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LRRC59Q96AG4 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LRRC59Q96AG4 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LRRC59Q96AG4 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LRRC59Q96AG4 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LRRC59Q96AG4 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LRRC59Q96AG4 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LRRC59Q96AG4 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LRRC59Q96AG4 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LRRC59Q96AG4 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LRRC59Q96AG4 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LRRC59Q96AG4 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LRRC59Q96AG4 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LRRC59Q96AG4 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LRRC59Q96AG4 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LRRC59Q96AG4 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LRRC59Q96AG4 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LRRC59Q96AG4 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
LRRC59Q96AG4 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LRRC59Q96AG4 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LRRC59Q96AG4 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LRRC59Q96AG4 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LRRC59Q96AG4 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LRRC59Q96AG4 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LRRC59Q96AG4 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
LRRC59Q96AG4 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LRRC59Q96AG4 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
LRRC59Q96AG4 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LRRC59Q96AG4 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LRRC59Q96AG4 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LRRC59Q96AG4 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LRRC59Q96AG4 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LRRC59Q96AG4 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LRRC59Q96AG4 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LRRC59Q96AG4 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LRRC59Q96AG4 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LRRC59Q96AG4 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LRRC59Q96AG4 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LRRC59Q96AG4 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
LRRC59Q96AG4 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LRRC59Q96AG4 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LRRC59Q96AG4 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LRRC59Q96AG4 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LRRC59Q96AG4 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LRRC59Q96AG4 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LRRC59Q96AG4 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LRRC59Q96AG4 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LRRC59Q96AG4 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LRRC59Q96AG4 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LRRC59Q96AG4 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LRRC59Q96AG4 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LRRC59Q96AG4 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LRRC59Q96AG4 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
LRRC59Q96AG4 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LRRC59Q96AG4 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LRRC59Q96AG4 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
LRRC59Q96AG4 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms