Protein–RNA interactions for Protein: Q92729

PTPRU, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, humanhuman

Predictions only

Length 1,446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRUQ92729 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PTPRUQ92729 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PTPRUQ92729 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PTPRUQ92729 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PTPRUQ92729 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTPRUQ92729 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTPRUQ92729 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTPRUQ92729 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTPRUQ92729 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
PTPRUQ92729 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTPRUQ92729 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTPRUQ92729 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTPRUQ92729 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTPRUQ92729 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTPRUQ92729 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTPRUQ92729 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTPRUQ92729 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
PTPRUQ92729 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
PTPRUQ92729 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTPRUQ92729 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTPRUQ92729 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
PTPRUQ92729 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTPRUQ92729 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTPRUQ92729 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTPRUQ92729 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTPRUQ92729 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTPRUQ92729 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTPRUQ92729 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTPRUQ92729 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
PTPRUQ92729 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTPRUQ92729 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTPRUQ92729 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTPRUQ92729 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTPRUQ92729 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTPRUQ92729 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
PTPRUQ92729 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTPRUQ92729 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTPRUQ92729 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTPRUQ92729 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
PTPRUQ92729 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
PTPRUQ92729 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTPRUQ92729 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTPRUQ92729 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTPRUQ92729 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTPRUQ92729 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTPRUQ92729 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTPRUQ92729 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTPRUQ92729 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTPRUQ92729 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTPRUQ92729 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTPRUQ92729 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTPRUQ92729 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTPRUQ92729 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTPRUQ92729 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTPRUQ92729 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTPRUQ92729 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTPRUQ92729 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTPRUQ92729 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTPRUQ92729 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTPRUQ92729 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTPRUQ92729 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTPRUQ92729 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTPRUQ92729 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTPRUQ92729 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTPRUQ92729 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTPRUQ92729 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTPRUQ92729 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTPRUQ92729 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTPRUQ92729 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTPRUQ92729 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTPRUQ92729 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTPRUQ92729 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTPRUQ92729 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTPRUQ92729 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTPRUQ92729 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
PTPRUQ92729 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTPRUQ92729 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
PTPRUQ92729 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTPRUQ92729 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTPRUQ92729 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTPRUQ92729 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTPRUQ92729 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTPRUQ92729 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTPRUQ92729 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTPRUQ92729 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTPRUQ92729 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTPRUQ92729 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTPRUQ92729 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTPRUQ92729 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTPRUQ92729 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTPRUQ92729 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTPRUQ92729 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTPRUQ92729 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTPRUQ92729 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTPRUQ92729 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTPRUQ92729 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTPRUQ92729 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTPRUQ92729 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTPRUQ92729 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTPRUQ92729 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms