Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV44

TRIM41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM41Q8WV44 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
TRIM41Q8WV44 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC33.22■■■□□ 2.91
TRIM41Q8WV44 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
TRIM41Q8WV44 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
TRIM41Q8WV44 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
TRIM41Q8WV44 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
TRIM41Q8WV44 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
TRIM41Q8WV44 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
TRIM41Q8WV44 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC33.22■■■□□ 2.91
TRIM41Q8WV44 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC33.22■■■□□ 2.91
TRIM41Q8WV44 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC33.22■■■□□ 2.91
TRIM41Q8WV44 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
TRIM41Q8WV44 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
TRIM41Q8WV44 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
TRIM41Q8WV44 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
TRIM41Q8WV44 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
TRIM41Q8WV44 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
TRIM41Q8WV44 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
TRIM41Q8WV44 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
TRIM41Q8WV44 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
TRIM41Q8WV44 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
TRIM41Q8WV44 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
TRIM41Q8WV44 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC33.21■■■□□ 2.91
TRIM41Q8WV44 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.21■■■□□ 2.91
TRIM41Q8WV44 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
TRIM41Q8WV44 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
TRIM41Q8WV44 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
TRIM41Q8WV44 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
TRIM41Q8WV44 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
TRIM41Q8WV44 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
TRIM41Q8WV44 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
TRIM41Q8WV44 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
TRIM41Q8WV44 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
TRIM41Q8WV44 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
TRIM41Q8WV44 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
TRIM41Q8WV44 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
TRIM41Q8WV44 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
TRIM41Q8WV44 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
TRIM41Q8WV44 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
TRIM41Q8WV44 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
TRIM41Q8WV44 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
TRIM41Q8WV44 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
TRIM41Q8WV44 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC33.2■■■□□ 2.91
TRIM41Q8WV44 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
TRIM41Q8WV44 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
TRIM41Q8WV44 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
TRIM41Q8WV44 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
TRIM41Q8WV44 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.9
TRIM41Q8WV44 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
TRIM41Q8WV44 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
TRIM41Q8WV44 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
TRIM41Q8WV44 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
TRIM41Q8WV44 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
TRIM41Q8WV44 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
TRIM41Q8WV44 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC33.19■■■□□ 2.9
TRIM41Q8WV44 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
TRIM41Q8WV44 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
TRIM41Q8WV44 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
TRIM41Q8WV44 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
TRIM41Q8WV44 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
TRIM41Q8WV44 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
TRIM41Q8WV44 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
TRIM41Q8WV44 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
TRIM41Q8WV44 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
TRIM41Q8WV44 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
TRIM41Q8WV44 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
TRIM41Q8WV44 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
TRIM41Q8WV44 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC33.18■■■□□ 2.9
TRIM41Q8WV44 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
TRIM41Q8WV44 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
TRIM41Q8WV44 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
TRIM41Q8WV44 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
TRIM41Q8WV44 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
TRIM41Q8WV44 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
TRIM41Q8WV44 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
TRIM41Q8WV44 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
TRIM41Q8WV44 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
TRIM41Q8WV44 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
TRIM41Q8WV44 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
TRIM41Q8WV44 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
TRIM41Q8WV44 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
TRIM41Q8WV44 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
TRIM41Q8WV44 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
TRIM41Q8WV44 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
TRIM41Q8WV44 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC33.17■■■□□ 2.9
TRIM41Q8WV44 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC33.17■■■□□ 2.9
TRIM41Q8WV44 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
TRIM41Q8WV44 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
TRIM41Q8WV44 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
TRIM41Q8WV44 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
TRIM41Q8WV44 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
TRIM41Q8WV44 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
TRIM41Q8WV44 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
TRIM41Q8WV44 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
TRIM41Q8WV44 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
TRIM41Q8WV44 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
TRIM41Q8WV44 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
TRIM41Q8WV44 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
TRIM41Q8WV44 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
TRIM41Q8WV44 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms