Protein–RNA interactions for Protein: Q8WU68

U2AF1L4, Splicing factor U2AF 26 kDa subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2AF1L4Q8WU68 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
U2AF1L4Q8WU68 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
U2AF1L4Q8WU68 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
U2AF1L4Q8WU68 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
U2AF1L4Q8WU68 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
U2AF1L4Q8WU68 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
U2AF1L4Q8WU68 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
U2AF1L4Q8WU68 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
U2AF1L4Q8WU68 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
U2AF1L4Q8WU68 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
U2AF1L4Q8WU68 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
U2AF1L4Q8WU68 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
U2AF1L4Q8WU68 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
U2AF1L4Q8WU68 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
U2AF1L4Q8WU68 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
U2AF1L4Q8WU68 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
U2AF1L4Q8WU68 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
U2AF1L4Q8WU68 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
U2AF1L4Q8WU68 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
U2AF1L4Q8WU68 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
U2AF1L4Q8WU68 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
U2AF1L4Q8WU68 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
U2AF1L4Q8WU68 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
U2AF1L4Q8WU68 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
U2AF1L4Q8WU68 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
U2AF1L4Q8WU68 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
U2AF1L4Q8WU68 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
U2AF1L4Q8WU68 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
U2AF1L4Q8WU68 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
U2AF1L4Q8WU68 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
U2AF1L4Q8WU68 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
U2AF1L4Q8WU68 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
U2AF1L4Q8WU68 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
U2AF1L4Q8WU68 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
U2AF1L4Q8WU68 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
U2AF1L4Q8WU68 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
U2AF1L4Q8WU68 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
U2AF1L4Q8WU68 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
U2AF1L4Q8WU68 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
U2AF1L4Q8WU68 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
U2AF1L4Q8WU68 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
U2AF1L4Q8WU68 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
U2AF1L4Q8WU68 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
U2AF1L4Q8WU68 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
U2AF1L4Q8WU68 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
U2AF1L4Q8WU68 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
U2AF1L4Q8WU68 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
U2AF1L4Q8WU68 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
U2AF1L4Q8WU68 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
U2AF1L4Q8WU68 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
U2AF1L4Q8WU68 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
U2AF1L4Q8WU68 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
U2AF1L4Q8WU68 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
U2AF1L4Q8WU68 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
U2AF1L4Q8WU68 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
U2AF1L4Q8WU68 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
U2AF1L4Q8WU68 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
U2AF1L4Q8WU68 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
U2AF1L4Q8WU68 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
U2AF1L4Q8WU68 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
U2AF1L4Q8WU68 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
U2AF1L4Q8WU68 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
U2AF1L4Q8WU68 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
U2AF1L4Q8WU68 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
U2AF1L4Q8WU68 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
U2AF1L4Q8WU68 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
U2AF1L4Q8WU68 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
U2AF1L4Q8WU68 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
U2AF1L4Q8WU68 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
U2AF1L4Q8WU68 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
U2AF1L4Q8WU68 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
U2AF1L4Q8WU68 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
U2AF1L4Q8WU68 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
U2AF1L4Q8WU68 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
U2AF1L4Q8WU68 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
U2AF1L4Q8WU68 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
U2AF1L4Q8WU68 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
U2AF1L4Q8WU68 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
U2AF1L4Q8WU68 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
U2AF1L4Q8WU68 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
U2AF1L4Q8WU68 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
U2AF1L4Q8WU68 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
U2AF1L4Q8WU68 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
U2AF1L4Q8WU68 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
U2AF1L4Q8WU68 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
U2AF1L4Q8WU68 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
U2AF1L4Q8WU68 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
U2AF1L4Q8WU68 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
U2AF1L4Q8WU68 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
U2AF1L4Q8WU68 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
U2AF1L4Q8WU68 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
U2AF1L4Q8WU68 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
U2AF1L4Q8WU68 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
U2AF1L4Q8WU68 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
U2AF1L4Q8WU68 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
U2AF1L4Q8WU68 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
U2AF1L4Q8WU68 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
U2AF1L4Q8WU68 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
U2AF1L4Q8WU68 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
U2AF1L4Q8WU68 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms