Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP7

KLHDC9, Kelch domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC9Q8NEP7 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHDC9Q8NEP7 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHDC9Q8NEP7 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHDC9Q8NEP7 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHDC9Q8NEP7 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHDC9Q8NEP7 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHDC9Q8NEP7 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHDC9Q8NEP7 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHDC9Q8NEP7 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHDC9Q8NEP7 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHDC9Q8NEP7 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHDC9Q8NEP7 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHDC9Q8NEP7 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHDC9Q8NEP7 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHDC9Q8NEP7 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHDC9Q8NEP7 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHDC9Q8NEP7 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHDC9Q8NEP7 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHDC9Q8NEP7 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHDC9Q8NEP7 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHDC9Q8NEP7 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHDC9Q8NEP7 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHDC9Q8NEP7 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHDC9Q8NEP7 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHDC9Q8NEP7 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHDC9Q8NEP7 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHDC9Q8NEP7 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHDC9Q8NEP7 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHDC9Q8NEP7 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHDC9Q8NEP7 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHDC9Q8NEP7 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHDC9Q8NEP7 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHDC9Q8NEP7 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHDC9Q8NEP7 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHDC9Q8NEP7 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHDC9Q8NEP7 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHDC9Q8NEP7 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHDC9Q8NEP7 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHDC9Q8NEP7 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHDC9Q8NEP7 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHDC9Q8NEP7 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHDC9Q8NEP7 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHDC9Q8NEP7 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHDC9Q8NEP7 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHDC9Q8NEP7 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHDC9Q8NEP7 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHDC9Q8NEP7 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHDC9Q8NEP7 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHDC9Q8NEP7 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHDC9Q8NEP7 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHDC9Q8NEP7 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHDC9Q8NEP7 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHDC9Q8NEP7 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHDC9Q8NEP7 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHDC9Q8NEP7 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHDC9Q8NEP7 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHDC9Q8NEP7 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHDC9Q8NEP7 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHDC9Q8NEP7 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHDC9Q8NEP7 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHDC9Q8NEP7 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHDC9Q8NEP7 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHDC9Q8NEP7 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHDC9Q8NEP7 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHDC9Q8NEP7 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHDC9Q8NEP7 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHDC9Q8NEP7 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHDC9Q8NEP7 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHDC9Q8NEP7 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHDC9Q8NEP7 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHDC9Q8NEP7 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHDC9Q8NEP7 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHDC9Q8NEP7 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHDC9Q8NEP7 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHDC9Q8NEP7 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHDC9Q8NEP7 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHDC9Q8NEP7 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHDC9Q8NEP7 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHDC9Q8NEP7 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHDC9Q8NEP7 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHDC9Q8NEP7 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHDC9Q8NEP7 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHDC9Q8NEP7 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHDC9Q8NEP7 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHDC9Q8NEP7 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHDC9Q8NEP7 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHDC9Q8NEP7 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHDC9Q8NEP7 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHDC9Q8NEP7 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHDC9Q8NEP7 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHDC9Q8NEP7 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHDC9Q8NEP7 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHDC9Q8NEP7 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHDC9Q8NEP7 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHDC9Q8NEP7 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHDC9Q8NEP7 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHDC9Q8NEP7 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHDC9Q8NEP7 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHDC9Q8NEP7 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHDC9Q8NEP7 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms