Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU4

CCDC191, Coiled-coil domain-containing protein 191, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC191Q8NCU4 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC191Q8NCU4 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC191Q8NCU4 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC191Q8NCU4 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC191Q8NCU4 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC191Q8NCU4 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC191Q8NCU4 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC191Q8NCU4 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC191Q8NCU4 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC191Q8NCU4 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC191Q8NCU4 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC191Q8NCU4 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC191Q8NCU4 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC191Q8NCU4 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC191Q8NCU4 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC191Q8NCU4 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC191Q8NCU4 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC191Q8NCU4 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC191Q8NCU4 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC191Q8NCU4 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC191Q8NCU4 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC191Q8NCU4 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC191Q8NCU4 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC191Q8NCU4 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC191Q8NCU4 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC191Q8NCU4 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC191Q8NCU4 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC191Q8NCU4 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC191Q8NCU4 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC191Q8NCU4 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC191Q8NCU4 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC191Q8NCU4 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC191Q8NCU4 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC191Q8NCU4 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC191Q8NCU4 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC191Q8NCU4 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC191Q8NCU4 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC191Q8NCU4 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC191Q8NCU4 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC191Q8NCU4 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC191Q8NCU4 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC191Q8NCU4 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC191Q8NCU4 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC191Q8NCU4 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC191Q8NCU4 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC191Q8NCU4 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC191Q8NCU4 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC191Q8NCU4 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC191Q8NCU4 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC191Q8NCU4 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC191Q8NCU4 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC191Q8NCU4 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC191Q8NCU4 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC191Q8NCU4 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC191Q8NCU4 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC191Q8NCU4 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC191Q8NCU4 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC191Q8NCU4 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC191Q8NCU4 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC191Q8NCU4 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC191Q8NCU4 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC191Q8NCU4 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC191Q8NCU4 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC191Q8NCU4 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC191Q8NCU4 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC191Q8NCU4 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC191Q8NCU4 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC191Q8NCU4 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC191Q8NCU4 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC191Q8NCU4 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC191Q8NCU4 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC191Q8NCU4 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC191Q8NCU4 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC191Q8NCU4 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC191Q8NCU4 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC191Q8NCU4 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC191Q8NCU4 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC191Q8NCU4 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC191Q8NCU4 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC191Q8NCU4 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC191Q8NCU4 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC191Q8NCU4 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC191Q8NCU4 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC191Q8NCU4 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC191Q8NCU4 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC191Q8NCU4 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC191Q8NCU4 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC191Q8NCU4 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC191Q8NCU4 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC191Q8NCU4 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC191Q8NCU4 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC191Q8NCU4 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC191Q8NCU4 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC191Q8NCU4 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC191Q8NCU4 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC191Q8NCU4 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC191Q8NCU4 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC191Q8NCU4 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC191Q8NCU4 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC191Q8NCU4 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms