Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6C5

IGSF1, Immunoglobulin superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF1Q8N6C5 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
IGSF1Q8N6C5 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
IGSF1Q8N6C5 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
IGSF1Q8N6C5 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
IGSF1Q8N6C5 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
IGSF1Q8N6C5 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
IGSF1Q8N6C5 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
IGSF1Q8N6C5 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
IGSF1Q8N6C5 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
IGSF1Q8N6C5 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
IGSF1Q8N6C5 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
IGSF1Q8N6C5 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
IGSF1Q8N6C5 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
IGSF1Q8N6C5 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
IGSF1Q8N6C5 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
IGSF1Q8N6C5 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
IGSF1Q8N6C5 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
IGSF1Q8N6C5 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
IGSF1Q8N6C5 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
IGSF1Q8N6C5 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
IGSF1Q8N6C5 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
IGSF1Q8N6C5 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
IGSF1Q8N6C5 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
IGSF1Q8N6C5 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
IGSF1Q8N6C5 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
IGSF1Q8N6C5 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
IGSF1Q8N6C5 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
IGSF1Q8N6C5 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
IGSF1Q8N6C5 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
IGSF1Q8N6C5 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
IGSF1Q8N6C5 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
IGSF1Q8N6C5 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
IGSF1Q8N6C5 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
IGSF1Q8N6C5 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
IGSF1Q8N6C5 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
IGSF1Q8N6C5 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
IGSF1Q8N6C5 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
IGSF1Q8N6C5 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
IGSF1Q8N6C5 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
IGSF1Q8N6C5 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
IGSF1Q8N6C5 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
IGSF1Q8N6C5 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
IGSF1Q8N6C5 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
IGSF1Q8N6C5 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
IGSF1Q8N6C5 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
IGSF1Q8N6C5 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
IGSF1Q8N6C5 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
IGSF1Q8N6C5 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
IGSF1Q8N6C5 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
IGSF1Q8N6C5 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
IGSF1Q8N6C5 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
IGSF1Q8N6C5 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
IGSF1Q8N6C5 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
IGSF1Q8N6C5 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
IGSF1Q8N6C5 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
IGSF1Q8N6C5 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
IGSF1Q8N6C5 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
IGSF1Q8N6C5 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
IGSF1Q8N6C5 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
IGSF1Q8N6C5 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
IGSF1Q8N6C5 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
IGSF1Q8N6C5 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
IGSF1Q8N6C5 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
IGSF1Q8N6C5 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
IGSF1Q8N6C5 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
IGSF1Q8N6C5 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
IGSF1Q8N6C5 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
IGSF1Q8N6C5 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
IGSF1Q8N6C5 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
IGSF1Q8N6C5 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
IGSF1Q8N6C5 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
IGSF1Q8N6C5 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
IGSF1Q8N6C5 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
IGSF1Q8N6C5 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
IGSF1Q8N6C5 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
IGSF1Q8N6C5 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
IGSF1Q8N6C5 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
IGSF1Q8N6C5 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
IGSF1Q8N6C5 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
IGSF1Q8N6C5 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
IGSF1Q8N6C5 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
IGSF1Q8N6C5 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
IGSF1Q8N6C5 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
IGSF1Q8N6C5 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
IGSF1Q8N6C5 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
IGSF1Q8N6C5 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
IGSF1Q8N6C5 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
IGSF1Q8N6C5 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
IGSF1Q8N6C5 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
IGSF1Q8N6C5 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
IGSF1Q8N6C5 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
IGSF1Q8N6C5 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
IGSF1Q8N6C5 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
IGSF1Q8N6C5 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
IGSF1Q8N6C5 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
IGSF1Q8N6C5 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
IGSF1Q8N6C5 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
IGSF1Q8N6C5 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
IGSF1Q8N6C5 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
IGSF1Q8N6C5 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms