Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUG1

KRTAP1-3, Keratin-associated protein 1-3, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-3Q8IUG1 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRTAP1-3Q8IUG1 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KRTAP1-3Q8IUG1 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KRTAP1-3Q8IUG1 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KRTAP1-3Q8IUG1 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KRTAP1-3Q8IUG1 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KRTAP1-3Q8IUG1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KRTAP1-3Q8IUG1 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KRTAP1-3Q8IUG1 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KRTAP1-3Q8IUG1 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KRTAP1-3Q8IUG1 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
KRTAP1-3Q8IUG1 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16■□□□□ 0.15
KRTAP1-3Q8IUG1 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
KRTAP1-3Q8IUG1 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC16■□□□□ 0.15
KRTAP1-3Q8IUG1 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KRTAP1-3Q8IUG1 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KRTAP1-3Q8IUG1 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KRTAP1-3Q8IUG1 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
KRTAP1-3Q8IUG1 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KRTAP1-3Q8IUG1 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KRTAP1-3Q8IUG1 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KRTAP1-3Q8IUG1 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
KRTAP1-3Q8IUG1 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KRTAP1-3Q8IUG1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KRTAP1-3Q8IUG1 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KRTAP1-3Q8IUG1 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KRTAP1-3Q8IUG1 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KRTAP1-3Q8IUG1 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRTAP1-3Q8IUG1 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRTAP1-3Q8IUG1 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRTAP1-3Q8IUG1 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
KRTAP1-3Q8IUG1 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRTAP1-3Q8IUG1 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRTAP1-3Q8IUG1 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRTAP1-3Q8IUG1 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRTAP1-3Q8IUG1 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRTAP1-3Q8IUG1 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRTAP1-3Q8IUG1 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
KRTAP1-3Q8IUG1 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
KRTAP1-3Q8IUG1 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRTAP1-3Q8IUG1 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRTAP1-3Q8IUG1 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRTAP1-3Q8IUG1 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRTAP1-3Q8IUG1 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRTAP1-3Q8IUG1 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRTAP1-3Q8IUG1 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRTAP1-3Q8IUG1 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRTAP1-3Q8IUG1 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRTAP1-3Q8IUG1 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRTAP1-3Q8IUG1 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRTAP1-3Q8IUG1 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRTAP1-3Q8IUG1 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRTAP1-3Q8IUG1 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRTAP1-3Q8IUG1 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRTAP1-3Q8IUG1 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRTAP1-3Q8IUG1 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRTAP1-3Q8IUG1 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRTAP1-3Q8IUG1 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRTAP1-3Q8IUG1 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRTAP1-3Q8IUG1 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
KRTAP1-3Q8IUG1 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRTAP1-3Q8IUG1 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
KRTAP1-3Q8IUG1 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRTAP1-3Q8IUG1 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
KRTAP1-3Q8IUG1 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRTAP1-3Q8IUG1 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRTAP1-3Q8IUG1 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRTAP1-3Q8IUG1 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRTAP1-3Q8IUG1 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRTAP1-3Q8IUG1 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRTAP1-3Q8IUG1 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRTAP1-3Q8IUG1 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRTAP1-3Q8IUG1 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRTAP1-3Q8IUG1 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRTAP1-3Q8IUG1 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRTAP1-3Q8IUG1 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRTAP1-3Q8IUG1 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRTAP1-3Q8IUG1 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRTAP1-3Q8IUG1 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRTAP1-3Q8IUG1 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRTAP1-3Q8IUG1 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRTAP1-3Q8IUG1 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRTAP1-3Q8IUG1 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRTAP1-3Q8IUG1 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRTAP1-3Q8IUG1 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRTAP1-3Q8IUG1 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRTAP1-3Q8IUG1 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRTAP1-3Q8IUG1 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRTAP1-3Q8IUG1 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRTAP1-3Q8IUG1 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRTAP1-3Q8IUG1 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRTAP1-3Q8IUG1 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
KRTAP1-3Q8IUG1 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRTAP1-3Q8IUG1 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRTAP1-3Q8IUG1 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRTAP1-3Q8IUG1 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRTAP1-3Q8IUG1 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRTAP1-3Q8IUG1 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRTAP1-3Q8IUG1 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRTAP1-3Q8IUG1 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms