Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD62

CTR9, RNA polymerase-associated protein CTR9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTR9Q6PD62 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CTR9Q6PD62 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTR9Q6PD62 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTR9Q6PD62 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CTR9Q6PD62 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTR9Q6PD62 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTR9Q6PD62 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTR9Q6PD62 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CTR9Q6PD62 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTR9Q6PD62 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTR9Q6PD62 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTR9Q6PD62 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTR9Q6PD62 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTR9Q6PD62 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTR9Q6PD62 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTR9Q6PD62 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTR9Q6PD62 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CTR9Q6PD62 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTR9Q6PD62 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTR9Q6PD62 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTR9Q6PD62 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTR9Q6PD62 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTR9Q6PD62 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTR9Q6PD62 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CTR9Q6PD62 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTR9Q6PD62 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTR9Q6PD62 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTR9Q6PD62 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTR9Q6PD62 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTR9Q6PD62 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTR9Q6PD62 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTR9Q6PD62 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTR9Q6PD62 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTR9Q6PD62 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTR9Q6PD62 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTR9Q6PD62 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTR9Q6PD62 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTR9Q6PD62 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTR9Q6PD62 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTR9Q6PD62 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTR9Q6PD62 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTR9Q6PD62 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTR9Q6PD62 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTR9Q6PD62 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTR9Q6PD62 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTR9Q6PD62 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTR9Q6PD62 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CTR9Q6PD62 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTR9Q6PD62 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTR9Q6PD62 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTR9Q6PD62 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTR9Q6PD62 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTR9Q6PD62 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTR9Q6PD62 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTR9Q6PD62 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTR9Q6PD62 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTR9Q6PD62 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTR9Q6PD62 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTR9Q6PD62 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CTR9Q6PD62 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTR9Q6PD62 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTR9Q6PD62 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTR9Q6PD62 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTR9Q6PD62 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTR9Q6PD62 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTR9Q6PD62 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTR9Q6PD62 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTR9Q6PD62 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CTR9Q6PD62 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTR9Q6PD62 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CTR9Q6PD62 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTR9Q6PD62 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTR9Q6PD62 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTR9Q6PD62 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTR9Q6PD62 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTR9Q6PD62 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
CTR9Q6PD62 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTR9Q6PD62 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTR9Q6PD62 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTR9Q6PD62 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTR9Q6PD62 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CTR9Q6PD62 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CTR9Q6PD62 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTR9Q6PD62 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CTR9Q6PD62 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTR9Q6PD62 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTR9Q6PD62 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTR9Q6PD62 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTR9Q6PD62 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTR9Q6PD62 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTR9Q6PD62 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTR9Q6PD62 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTR9Q6PD62 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTR9Q6PD62 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTR9Q6PD62 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CTR9Q6PD62 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CTR9Q6PD62 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CTR9Q6PD62 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CTR9Q6PD62 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CTR9Q6PD62 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms