Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ANKRD54Q6NXT1 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ANKRD54Q6NXT1 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ANKRD54Q6NXT1 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ANKRD54Q6NXT1 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ANKRD54Q6NXT1 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ANKRD54Q6NXT1 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ANKRD54Q6NXT1 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ANKRD54Q6NXT1 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ANKRD54Q6NXT1 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ANKRD54Q6NXT1 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ANKRD54Q6NXT1 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ANKRD54Q6NXT1 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ANKRD54Q6NXT1 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ANKRD54Q6NXT1 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ANKRD54Q6NXT1 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ANKRD54Q6NXT1 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ANKRD54Q6NXT1 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ANKRD54Q6NXT1 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ANKRD54Q6NXT1 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ANKRD54Q6NXT1 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ANKRD54Q6NXT1 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ANKRD54Q6NXT1 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ANKRD54Q6NXT1 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ANKRD54Q6NXT1 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ANKRD54Q6NXT1 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
ANKRD54Q6NXT1 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ANKRD54Q6NXT1 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ANKRD54Q6NXT1 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ANKRD54Q6NXT1 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ANKRD54Q6NXT1 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ANKRD54Q6NXT1 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ANKRD54Q6NXT1 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ANKRD54Q6NXT1 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ANKRD54Q6NXT1 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ANKRD54Q6NXT1 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ANKRD54Q6NXT1 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ANKRD54Q6NXT1 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ANKRD54Q6NXT1 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ANKRD54Q6NXT1 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ANKRD54Q6NXT1 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ANKRD54Q6NXT1 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ANKRD54Q6NXT1 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ANKRD54Q6NXT1 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ANKRD54Q6NXT1 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ANKRD54Q6NXT1 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ANKRD54Q6NXT1 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ANKRD54Q6NXT1 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ANKRD54Q6NXT1 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ANKRD54Q6NXT1 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ANKRD54Q6NXT1 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ANKRD54Q6NXT1 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ANKRD54Q6NXT1 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ANKRD54Q6NXT1 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ANKRD54Q6NXT1 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ANKRD54Q6NXT1 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ANKRD54Q6NXT1 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ANKRD54Q6NXT1 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ANKRD54Q6NXT1 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ANKRD54Q6NXT1 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ANKRD54Q6NXT1 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ANKRD54Q6NXT1 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ANKRD54Q6NXT1 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ANKRD54Q6NXT1 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ANKRD54Q6NXT1 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ANKRD54Q6NXT1 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ANKRD54Q6NXT1 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ANKRD54Q6NXT1 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ANKRD54Q6NXT1 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ANKRD54Q6NXT1 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ANKRD54Q6NXT1 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ANKRD54Q6NXT1 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ANKRD54Q6NXT1 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ANKRD54Q6NXT1 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ANKRD54Q6NXT1 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ANKRD54Q6NXT1 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ANKRD54Q6NXT1 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ANKRD54Q6NXT1 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ANKRD54Q6NXT1 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ANKRD54Q6NXT1 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ANKRD54Q6NXT1 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ANKRD54Q6NXT1 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ANKRD54Q6NXT1 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ANKRD54Q6NXT1 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ANKRD54Q6NXT1 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ANKRD54Q6NXT1 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ANKRD54Q6NXT1 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ANKRD54Q6NXT1 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ANKRD54Q6NXT1 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ANKRD54Q6NXT1 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ANKRD54Q6NXT1 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ANKRD54Q6NXT1 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ANKRD54Q6NXT1 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ANKRD54Q6NXT1 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ANKRD54Q6NXT1 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ANKRD54Q6NXT1 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ANKRD54Q6NXT1 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ANKRD54Q6NXT1 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ANKRD54Q6NXT1 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ANKRD54Q6NXT1 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms