Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT5

MYOM3, Myomesin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYOM3Q5VTT5 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
MYOM3Q5VTT5 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
MYOM3Q5VTT5 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
MYOM3Q5VTT5 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
MYOM3Q5VTT5 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
MYOM3Q5VTT5 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
MYOM3Q5VTT5 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
MYOM3Q5VTT5 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
MYOM3Q5VTT5 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
MYOM3Q5VTT5 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
MYOM3Q5VTT5 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
MYOM3Q5VTT5 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
MYOM3Q5VTT5 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
MYOM3Q5VTT5 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
MYOM3Q5VTT5 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
MYOM3Q5VTT5 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
MYOM3Q5VTT5 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
MYOM3Q5VTT5 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
MYOM3Q5VTT5 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
MYOM3Q5VTT5 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
MYOM3Q5VTT5 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
MYOM3Q5VTT5 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
MYOM3Q5VTT5 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
MYOM3Q5VTT5 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
MYOM3Q5VTT5 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
MYOM3Q5VTT5 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
MYOM3Q5VTT5 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
MYOM3Q5VTT5 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
MYOM3Q5VTT5 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
MYOM3Q5VTT5 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
MYOM3Q5VTT5 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
MYOM3Q5VTT5 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
MYOM3Q5VTT5 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
MYOM3Q5VTT5 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
MYOM3Q5VTT5 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
MYOM3Q5VTT5 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
MYOM3Q5VTT5 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
MYOM3Q5VTT5 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
MYOM3Q5VTT5 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
MYOM3Q5VTT5 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
MYOM3Q5VTT5 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
MYOM3Q5VTT5 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
MYOM3Q5VTT5 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
MYOM3Q5VTT5 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
MYOM3Q5VTT5 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
MYOM3Q5VTT5 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
MYOM3Q5VTT5 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
MYOM3Q5VTT5 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
MYOM3Q5VTT5 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
MYOM3Q5VTT5 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
MYOM3Q5VTT5 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
MYOM3Q5VTT5 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
MYOM3Q5VTT5 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
MYOM3Q5VTT5 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
MYOM3Q5VTT5 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
MYOM3Q5VTT5 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
MYOM3Q5VTT5 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
MYOM3Q5VTT5 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
MYOM3Q5VTT5 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
MYOM3Q5VTT5 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
MYOM3Q5VTT5 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
MYOM3Q5VTT5 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
MYOM3Q5VTT5 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
MYOM3Q5VTT5 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
MYOM3Q5VTT5 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
MYOM3Q5VTT5 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
MYOM3Q5VTT5 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
MYOM3Q5VTT5 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
MYOM3Q5VTT5 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
MYOM3Q5VTT5 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
MYOM3Q5VTT5 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
MYOM3Q5VTT5 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
MYOM3Q5VTT5 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.29
MYOM3Q5VTT5 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
MYOM3Q5VTT5 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
MYOM3Q5VTT5 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
MYOM3Q5VTT5 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
MYOM3Q5VTT5 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
MYOM3Q5VTT5 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
MYOM3Q5VTT5 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
MYOM3Q5VTT5 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
MYOM3Q5VTT5 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
MYOM3Q5VTT5 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
MYOM3Q5VTT5 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
MYOM3Q5VTT5 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
MYOM3Q5VTT5 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
MYOM3Q5VTT5 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
MYOM3Q5VTT5 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
MYOM3Q5VTT5 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
MYOM3Q5VTT5 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
MYOM3Q5VTT5 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
MYOM3Q5VTT5 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
MYOM3Q5VTT5 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
MYOM3Q5VTT5 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
MYOM3Q5VTT5 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
MYOM3Q5VTT5 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
MYOM3Q5VTT5 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
MYOM3Q5VTT5 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
MYOM3Q5VTT5 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
MYOM3Q5VTT5 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms