Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW7

C10orf55, Uncharacterized protein C10orf55, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf55Q5SWW7 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C10orf55Q5SWW7 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C10orf55Q5SWW7 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C10orf55Q5SWW7 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C10orf55Q5SWW7 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C10orf55Q5SWW7 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C10orf55Q5SWW7 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C10orf55Q5SWW7 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C10orf55Q5SWW7 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C10orf55Q5SWW7 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C10orf55Q5SWW7 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C10orf55Q5SWW7 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C10orf55Q5SWW7 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C10orf55Q5SWW7 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C10orf55Q5SWW7 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C10orf55Q5SWW7 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C10orf55Q5SWW7 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C10orf55Q5SWW7 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
C10orf55Q5SWW7 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C10orf55Q5SWW7 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C10orf55Q5SWW7 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
C10orf55Q5SWW7 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C10orf55Q5SWW7 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C10orf55Q5SWW7 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C10orf55Q5SWW7 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C10orf55Q5SWW7 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C10orf55Q5SWW7 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C10orf55Q5SWW7 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C10orf55Q5SWW7 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C10orf55Q5SWW7 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
C10orf55Q5SWW7 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C10orf55Q5SWW7 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C10orf55Q5SWW7 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C10orf55Q5SWW7 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C10orf55Q5SWW7 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C10orf55Q5SWW7 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C10orf55Q5SWW7 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C10orf55Q5SWW7 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C10orf55Q5SWW7 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C10orf55Q5SWW7 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C10orf55Q5SWW7 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C10orf55Q5SWW7 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C10orf55Q5SWW7 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C10orf55Q5SWW7 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C10orf55Q5SWW7 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C10orf55Q5SWW7 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C10orf55Q5SWW7 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C10orf55Q5SWW7 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C10orf55Q5SWW7 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C10orf55Q5SWW7 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
C10orf55Q5SWW7 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C10orf55Q5SWW7 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C10orf55Q5SWW7 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C10orf55Q5SWW7 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C10orf55Q5SWW7 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C10orf55Q5SWW7 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C10orf55Q5SWW7 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C10orf55Q5SWW7 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C10orf55Q5SWW7 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C10orf55Q5SWW7 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C10orf55Q5SWW7 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C10orf55Q5SWW7 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C10orf55Q5SWW7 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C10orf55Q5SWW7 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C10orf55Q5SWW7 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C10orf55Q5SWW7 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C10orf55Q5SWW7 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C10orf55Q5SWW7 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C10orf55Q5SWW7 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C10orf55Q5SWW7 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C10orf55Q5SWW7 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
C10orf55Q5SWW7 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C10orf55Q5SWW7 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C10orf55Q5SWW7 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
C10orf55Q5SWW7 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C10orf55Q5SWW7 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C10orf55Q5SWW7 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C10orf55Q5SWW7 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C10orf55Q5SWW7 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C10orf55Q5SWW7 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C10orf55Q5SWW7 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C10orf55Q5SWW7 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C10orf55Q5SWW7 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C10orf55Q5SWW7 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C10orf55Q5SWW7 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C10orf55Q5SWW7 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C10orf55Q5SWW7 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C10orf55Q5SWW7 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C10orf55Q5SWW7 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C10orf55Q5SWW7 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C10orf55Q5SWW7 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
C10orf55Q5SWW7 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C10orf55Q5SWW7 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C10orf55Q5SWW7 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C10orf55Q5SWW7 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C10orf55Q5SWW7 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C10orf55Q5SWW7 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C10orf55Q5SWW7 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C10orf55Q5SWW7 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C10orf55Q5SWW7 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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