Protein–RNA interactions for Protein: Q49MI3

CERKL, Ceramide kinase-like protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CERKLQ49MI3 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CERKLQ49MI3 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CERKLQ49MI3 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CERKLQ49MI3 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CERKLQ49MI3 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CERKLQ49MI3 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CERKLQ49MI3 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CERKLQ49MI3 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CERKLQ49MI3 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CERKLQ49MI3 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CERKLQ49MI3 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CERKLQ49MI3 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CERKLQ49MI3 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CERKLQ49MI3 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CERKLQ49MI3 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CERKLQ49MI3 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CERKLQ49MI3 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CERKLQ49MI3 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CERKLQ49MI3 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CERKLQ49MI3 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CERKLQ49MI3 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CERKLQ49MI3 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CERKLQ49MI3 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CERKLQ49MI3 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CERKLQ49MI3 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CERKLQ49MI3 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CERKLQ49MI3 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CERKLQ49MI3 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CERKLQ49MI3 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CERKLQ49MI3 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CERKLQ49MI3 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CERKLQ49MI3 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CERKLQ49MI3 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CERKLQ49MI3 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CERKLQ49MI3 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CERKLQ49MI3 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CERKLQ49MI3 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CERKLQ49MI3 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CERKLQ49MI3 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CERKLQ49MI3 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CERKLQ49MI3 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CERKLQ49MI3 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CERKLQ49MI3 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CERKLQ49MI3 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CERKLQ49MI3 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CERKLQ49MI3 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CERKLQ49MI3 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CERKLQ49MI3 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CERKLQ49MI3 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CERKLQ49MI3 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CERKLQ49MI3 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CERKLQ49MI3 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CERKLQ49MI3 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CERKLQ49MI3 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CERKLQ49MI3 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CERKLQ49MI3 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CERKLQ49MI3 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CERKLQ49MI3 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CERKLQ49MI3 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CERKLQ49MI3 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CERKLQ49MI3 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CERKLQ49MI3 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CERKLQ49MI3 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CERKLQ49MI3 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CERKLQ49MI3 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CERKLQ49MI3 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CERKLQ49MI3 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CERKLQ49MI3 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CERKLQ49MI3 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CERKLQ49MI3 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CERKLQ49MI3 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CERKLQ49MI3 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CERKLQ49MI3 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CERKLQ49MI3 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CERKLQ49MI3 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CERKLQ49MI3 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CERKLQ49MI3 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CERKLQ49MI3 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CERKLQ49MI3 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CERKLQ49MI3 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CERKLQ49MI3 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CERKLQ49MI3 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CERKLQ49MI3 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CERKLQ49MI3 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CERKLQ49MI3 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CERKLQ49MI3 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CERKLQ49MI3 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CERKLQ49MI3 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CERKLQ49MI3 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CERKLQ49MI3 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CERKLQ49MI3 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CERKLQ49MI3 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CERKLQ49MI3 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CERKLQ49MI3 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CERKLQ49MI3 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CERKLQ49MI3 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CERKLQ49MI3 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CERKLQ49MI3 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CERKLQ49MI3 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CERKLQ49MI3 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms