Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF239Q16600 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF239Q16600 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF239Q16600 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF239Q16600 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF239Q16600 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF239Q16600 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF239Q16600 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF239Q16600 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF239Q16600 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF239Q16600 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF239Q16600 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF239Q16600 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF239Q16600 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF239Q16600 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF239Q16600 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF239Q16600 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF239Q16600 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF239Q16600 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF239Q16600 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF239Q16600 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF239Q16600 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF239Q16600 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF239Q16600 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF239Q16600 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF239Q16600 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF239Q16600 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF239Q16600 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF239Q16600 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF239Q16600 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF239Q16600 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
ZNF239Q16600 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
ZNF239Q16600 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
ZNF239Q16600 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF239Q16600 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF239Q16600 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF239Q16600 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF239Q16600 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF239Q16600 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF239Q16600 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF239Q16600 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF239Q16600 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF239Q16600 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF239Q16600 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF239Q16600 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF239Q16600 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF239Q16600 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF239Q16600 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF239Q16600 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF239Q16600 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF239Q16600 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF239Q16600 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF239Q16600 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF239Q16600 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF239Q16600 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF239Q16600 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF239Q16600 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF239Q16600 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF239Q16600 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF239Q16600 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF239Q16600 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF239Q16600 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF239Q16600 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF239Q16600 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF239Q16600 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF239Q16600 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF239Q16600 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF239Q16600 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF239Q16600 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF239Q16600 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF239Q16600 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF239Q16600 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF239Q16600 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF239Q16600 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF239Q16600 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF239Q16600 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF239Q16600 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF239Q16600 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF239Q16600 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF239Q16600 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF239Q16600 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF239Q16600 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF239Q16600 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF239Q16600 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF239Q16600 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF239Q16600 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF239Q16600 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF239Q16600 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF239Q16600 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF239Q16600 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF239Q16600 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF239Q16600 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF239Q16600 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF239Q16600 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF239Q16600 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF239Q16600 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF239Q16600 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF239Q16600 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF239Q16600 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF239Q16600 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
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