Protein–RNA interactions for Protein: Q13868

EXOSC2, Exosome complex component RRP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC2Q13868 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EXOSC2Q13868 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms