Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATRQ13535 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ATRQ13535 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATRQ13535 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATRQ13535 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATRQ13535 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATRQ13535 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATRQ13535 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ATRQ13535 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATRQ13535 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATRQ13535 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATRQ13535 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATRQ13535 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATRQ13535 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATRQ13535 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATRQ13535 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATRQ13535 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ATRQ13535 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATRQ13535 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATRQ13535 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATRQ13535 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATRQ13535 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATRQ13535 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ATRQ13535 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATRQ13535 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATRQ13535 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ATRQ13535 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATRQ13535 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATRQ13535 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATRQ13535 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ATRQ13535 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATRQ13535 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATRQ13535 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATRQ13535 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATRQ13535 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATRQ13535 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATRQ13535 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATRQ13535 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATRQ13535 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATRQ13535 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATRQ13535 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATRQ13535 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATRQ13535 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATRQ13535 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
ATRQ13535 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATRQ13535 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
ATRQ13535 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATRQ13535 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATRQ13535 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATRQ13535 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATRQ13535 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATRQ13535 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATRQ13535 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATRQ13535 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATRQ13535 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATRQ13535 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATRQ13535 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATRQ13535 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATRQ13535 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATRQ13535 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATRQ13535 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATRQ13535 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATRQ13535 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATRQ13535 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATRQ13535 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATRQ13535 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATRQ13535 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATRQ13535 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATRQ13535 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATRQ13535 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATRQ13535 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATRQ13535 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATRQ13535 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATRQ13535 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATRQ13535 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATRQ13535 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATRQ13535 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATRQ13535 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATRQ13535 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATRQ13535 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ATRQ13535 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATRQ13535 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATRQ13535 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATRQ13535 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATRQ13535 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATRQ13535 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ATRQ13535 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATRQ13535 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATRQ13535 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATRQ13535 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ATRQ13535 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ATRQ13535 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATRQ13535 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATRQ13535 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATRQ13535 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATRQ13535 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATRQ13535 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATRQ13535 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATRQ13535 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATRQ13535 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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