Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SKP2Q13309 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SKP2Q13309 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SKP2Q13309 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SKP2Q13309 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SKP2Q13309 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SKP2Q13309 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SKP2Q13309 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SKP2Q13309 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SKP2Q13309 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SKP2Q13309 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SKP2Q13309 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SKP2Q13309 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SKP2Q13309 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SKP2Q13309 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SKP2Q13309 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SKP2Q13309 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SKP2Q13309 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SKP2Q13309 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SKP2Q13309 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SKP2Q13309 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SKP2Q13309 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SKP2Q13309 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SKP2Q13309 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SKP2Q13309 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SKP2Q13309 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SKP2Q13309 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SKP2Q13309 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SKP2Q13309 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SKP2Q13309 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SKP2Q13309 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SKP2Q13309 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SKP2Q13309 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SKP2Q13309 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SKP2Q13309 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SKP2Q13309 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SKP2Q13309 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SKP2Q13309 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SKP2Q13309 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SKP2Q13309 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SKP2Q13309 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SKP2Q13309 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SKP2Q13309 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SKP2Q13309 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SKP2Q13309 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SKP2Q13309 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SKP2Q13309 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SKP2Q13309 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SKP2Q13309 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SKP2Q13309 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SKP2Q13309 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SKP2Q13309 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SKP2Q13309 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SKP2Q13309 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SKP2Q13309 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SKP2Q13309 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SKP2Q13309 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SKP2Q13309 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SKP2Q13309 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SKP2Q13309 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SKP2Q13309 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SKP2Q13309 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SKP2Q13309 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SKP2Q13309 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SKP2Q13309 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SKP2Q13309 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SKP2Q13309 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SKP2Q13309 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SKP2Q13309 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SKP2Q13309 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SKP2Q13309 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SKP2Q13309 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SKP2Q13309 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SKP2Q13309 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SKP2Q13309 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SKP2Q13309 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
SKP2Q13309 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SKP2Q13309 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SKP2Q13309 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
SKP2Q13309 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SKP2Q13309 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SKP2Q13309 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SKP2Q13309 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SKP2Q13309 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SKP2Q13309 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SKP2Q13309 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SKP2Q13309 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SKP2Q13309 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SKP2Q13309 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SKP2Q13309 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SKP2Q13309 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SKP2Q13309 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SKP2Q13309 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SKP2Q13309 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SKP2Q13309 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SKP2Q13309 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SKP2Q13309 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SKP2Q13309 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SKP2Q13309 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SKP2Q13309 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms