Protein–RNA interactions for Protein: Q12805

EFEMP1, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFEMP1Q12805 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EFEMP1Q12805 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EFEMP1Q12805 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EFEMP1Q12805 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EFEMP1Q12805 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EFEMP1Q12805 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EFEMP1Q12805 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EFEMP1Q12805 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EFEMP1Q12805 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EFEMP1Q12805 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EFEMP1Q12805 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EFEMP1Q12805 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EFEMP1Q12805 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EFEMP1Q12805 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EFEMP1Q12805 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EFEMP1Q12805 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EFEMP1Q12805 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EFEMP1Q12805 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EFEMP1Q12805 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EFEMP1Q12805 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EFEMP1Q12805 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EFEMP1Q12805 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EFEMP1Q12805 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EFEMP1Q12805 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EFEMP1Q12805 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EFEMP1Q12805 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EFEMP1Q12805 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EFEMP1Q12805 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EFEMP1Q12805 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EFEMP1Q12805 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EFEMP1Q12805 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EFEMP1Q12805 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EFEMP1Q12805 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EFEMP1Q12805 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EFEMP1Q12805 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EFEMP1Q12805 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
EFEMP1Q12805 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EFEMP1Q12805 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EFEMP1Q12805 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EFEMP1Q12805 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EFEMP1Q12805 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EFEMP1Q12805 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EFEMP1Q12805 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EFEMP1Q12805 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EFEMP1Q12805 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EFEMP1Q12805 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EFEMP1Q12805 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EFEMP1Q12805 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EFEMP1Q12805 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EFEMP1Q12805 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EFEMP1Q12805 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EFEMP1Q12805 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EFEMP1Q12805 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
EFEMP1Q12805 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
EFEMP1Q12805 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
EFEMP1Q12805 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EFEMP1Q12805 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EFEMP1Q12805 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EFEMP1Q12805 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EFEMP1Q12805 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EFEMP1Q12805 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EFEMP1Q12805 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EFEMP1Q12805 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
EFEMP1Q12805 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EFEMP1Q12805 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EFEMP1Q12805 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EFEMP1Q12805 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EFEMP1Q12805 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EFEMP1Q12805 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EFEMP1Q12805 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
EFEMP1Q12805 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EFEMP1Q12805 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EFEMP1Q12805 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EFEMP1Q12805 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
EFEMP1Q12805 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EFEMP1Q12805 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
EFEMP1Q12805 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EFEMP1Q12805 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
EFEMP1Q12805 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EFEMP1Q12805 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
EFEMP1Q12805 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EFEMP1Q12805 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EFEMP1Q12805 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EFEMP1Q12805 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EFEMP1Q12805 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EFEMP1Q12805 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EFEMP1Q12805 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EFEMP1Q12805 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EFEMP1Q12805 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
EFEMP1Q12805 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EFEMP1Q12805 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
EFEMP1Q12805 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
EFEMP1Q12805 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
EFEMP1Q12805 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
EFEMP1Q12805 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EFEMP1Q12805 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EFEMP1Q12805 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EFEMP1Q12805 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EFEMP1Q12805 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EFEMP1Q12805 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
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