Protein–RNA interactions for Protein: Q08345

DDR1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR1Q08345 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DDR1Q08345 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DDR1Q08345 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DDR1Q08345 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DDR1Q08345 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DDR1Q08345 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DDR1Q08345 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DDR1Q08345 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DDR1Q08345 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DDR1Q08345 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DDR1Q08345 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DDR1Q08345 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DDR1Q08345 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DDR1Q08345 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DDR1Q08345 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DDR1Q08345 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DDR1Q08345 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DDR1Q08345 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DDR1Q08345 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
DDR1Q08345 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
DDR1Q08345 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DDR1Q08345 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DDR1Q08345 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DDR1Q08345 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DDR1Q08345 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DDR1Q08345 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DDR1Q08345 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DDR1Q08345 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DDR1Q08345 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DDR1Q08345 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DDR1Q08345 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DDR1Q08345 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DDR1Q08345 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DDR1Q08345 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DDR1Q08345 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DDR1Q08345 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
DDR1Q08345 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DDR1Q08345 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DDR1Q08345 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DDR1Q08345 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
DDR1Q08345 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DDR1Q08345 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DDR1Q08345 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DDR1Q08345 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DDR1Q08345 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DDR1Q08345 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DDR1Q08345 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DDR1Q08345 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DDR1Q08345 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
DDR1Q08345 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
DDR1Q08345 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DDR1Q08345 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DDR1Q08345 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
DDR1Q08345 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
DDR1Q08345 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DDR1Q08345 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
DDR1Q08345 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DDR1Q08345 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
DDR1Q08345 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DDR1Q08345 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DDR1Q08345 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DDR1Q08345 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DDR1Q08345 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DDR1Q08345 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DDR1Q08345 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DDR1Q08345 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DDR1Q08345 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DDR1Q08345 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
DDR1Q08345 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DDR1Q08345 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DDR1Q08345 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DDR1Q08345 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DDR1Q08345 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DDR1Q08345 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DDR1Q08345 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DDR1Q08345 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DDR1Q08345 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DDR1Q08345 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DDR1Q08345 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DDR1Q08345 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DDR1Q08345 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DDR1Q08345 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DDR1Q08345 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DDR1Q08345 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DDR1Q08345 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DDR1Q08345 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DDR1Q08345 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DDR1Q08345 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DDR1Q08345 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DDR1Q08345 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DDR1Q08345 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
DDR1Q08345 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DDR1Q08345 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DDR1Q08345 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DDR1Q08345 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DDR1Q08345 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DDR1Q08345 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DDR1Q08345 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DDR1Q08345 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DDR1Q08345 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms