Protein–RNA interactions for Protein: Q07343

PDE4B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4B, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4BQ07343 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDE4BQ07343 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDE4BQ07343 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDE4BQ07343 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDE4BQ07343 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDE4BQ07343 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDE4BQ07343 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PDE4BQ07343 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDE4BQ07343 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDE4BQ07343 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDE4BQ07343 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDE4BQ07343 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDE4BQ07343 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDE4BQ07343 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDE4BQ07343 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDE4BQ07343 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDE4BQ07343 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDE4BQ07343 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PDE4BQ07343 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDE4BQ07343 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDE4BQ07343 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDE4BQ07343 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDE4BQ07343 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDE4BQ07343 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDE4BQ07343 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDE4BQ07343 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDE4BQ07343 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDE4BQ07343 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PDE4BQ07343 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDE4BQ07343 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDE4BQ07343 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDE4BQ07343 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDE4BQ07343 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDE4BQ07343 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDE4BQ07343 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDE4BQ07343 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDE4BQ07343 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDE4BQ07343 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDE4BQ07343 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDE4BQ07343 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDE4BQ07343 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE4BQ07343 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE4BQ07343 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE4BQ07343 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE4BQ07343 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE4BQ07343 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE4BQ07343 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE4BQ07343 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE4BQ07343 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE4BQ07343 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE4BQ07343 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE4BQ07343 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE4BQ07343 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE4BQ07343 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE4BQ07343 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE4BQ07343 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE4BQ07343 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE4BQ07343 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE4BQ07343 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE4BQ07343 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE4BQ07343 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE4BQ07343 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE4BQ07343 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE4BQ07343 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE4BQ07343 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE4BQ07343 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDE4BQ07343 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDE4BQ07343 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDE4BQ07343 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDE4BQ07343 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDE4BQ07343 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDE4BQ07343 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDE4BQ07343 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDE4BQ07343 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDE4BQ07343 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDE4BQ07343 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDE4BQ07343 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDE4BQ07343 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDE4BQ07343 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDE4BQ07343 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDE4BQ07343 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PDE4BQ07343 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDE4BQ07343 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDE4BQ07343 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PDE4BQ07343 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDE4BQ07343 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDE4BQ07343 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDE4BQ07343 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PDE4BQ07343 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PDE4BQ07343 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PDE4BQ07343 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PDE4BQ07343 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDE4BQ07343 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDE4BQ07343 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PDE4BQ07343 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDE4BQ07343 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDE4BQ07343 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PDE4BQ07343 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDE4BQ07343 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDE4BQ07343 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms