Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CXCL9Q07325 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CXCL9Q07325 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CXCL9Q07325 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CXCL9Q07325 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CXCL9Q07325 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CXCL9Q07325 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CXCL9Q07325 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CXCL9Q07325 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CXCL9Q07325 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CXCL9Q07325 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CXCL9Q07325 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CXCL9Q07325 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CXCL9Q07325 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CXCL9Q07325 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CXCL9Q07325 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CXCL9Q07325 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
CXCL9Q07325 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
CXCL9Q07325 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CXCL9Q07325 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CXCL9Q07325 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CXCL9Q07325 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CXCL9Q07325 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CXCL9Q07325 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CXCL9Q07325 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CXCL9Q07325 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CXCL9Q07325 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CXCL9Q07325 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CXCL9Q07325 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CXCL9Q07325 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CXCL9Q07325 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CXCL9Q07325 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CXCL9Q07325 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CXCL9Q07325 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CXCL9Q07325 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CXCL9Q07325 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CXCL9Q07325 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CXCL9Q07325 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CXCL9Q07325 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CXCL9Q07325 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CXCL9Q07325 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CXCL9Q07325 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CXCL9Q07325 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CXCL9Q07325 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CXCL9Q07325 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CXCL9Q07325 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CXCL9Q07325 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CXCL9Q07325 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CXCL9Q07325 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CXCL9Q07325 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CXCL9Q07325 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CXCL9Q07325 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CXCL9Q07325 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CXCL9Q07325 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CXCL9Q07325 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CXCL9Q07325 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CXCL9Q07325 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CXCL9Q07325 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CXCL9Q07325 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CXCL9Q07325 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CXCL9Q07325 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CXCL9Q07325 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CXCL9Q07325 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CXCL9Q07325 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CXCL9Q07325 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CXCL9Q07325 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CXCL9Q07325 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CXCL9Q07325 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CXCL9Q07325 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CXCL9Q07325 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CXCL9Q07325 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CXCL9Q07325 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CXCL9Q07325 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CXCL9Q07325 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CXCL9Q07325 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CXCL9Q07325 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CXCL9Q07325 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CXCL9Q07325 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CXCL9Q07325 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CXCL9Q07325 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CXCL9Q07325 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CXCL9Q07325 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CXCL9Q07325 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CXCL9Q07325 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CXCL9Q07325 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CXCL9Q07325 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CXCL9Q07325 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CXCL9Q07325 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CXCL9Q07325 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CXCL9Q07325 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CXCL9Q07325 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CXCL9Q07325 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CXCL9Q07325 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CXCL9Q07325 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CXCL9Q07325 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CXCL9Q07325 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CXCL9Q07325 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CXCL9Q07325 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CXCL9Q07325 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CXCL9Q07325 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms