Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CALD1Q05682 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CALD1Q05682 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CALD1Q05682 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CALD1Q05682 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CALD1Q05682 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CALD1Q05682 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CALD1Q05682 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CALD1Q05682 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CALD1Q05682 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CALD1Q05682 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CALD1Q05682 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CALD1Q05682 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CALD1Q05682 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CALD1Q05682 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CALD1Q05682 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CALD1Q05682 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CALD1Q05682 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CALD1Q05682 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CALD1Q05682 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CALD1Q05682 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CALD1Q05682 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CALD1Q05682 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CALD1Q05682 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CALD1Q05682 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CALD1Q05682 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CALD1Q05682 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CALD1Q05682 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CALD1Q05682 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CALD1Q05682 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CALD1Q05682 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CALD1Q05682 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CALD1Q05682 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CALD1Q05682 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CALD1Q05682 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CALD1Q05682 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CALD1Q05682 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CALD1Q05682 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CALD1Q05682 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CALD1Q05682 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CALD1Q05682 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CALD1Q05682 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CALD1Q05682 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CALD1Q05682 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CALD1Q05682 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CALD1Q05682 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CALD1Q05682 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CALD1Q05682 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CALD1Q05682 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CALD1Q05682 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CALD1Q05682 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CALD1Q05682 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CALD1Q05682 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CALD1Q05682 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CALD1Q05682 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CALD1Q05682 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CALD1Q05682 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CALD1Q05682 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CALD1Q05682 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CALD1Q05682 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CALD1Q05682 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CALD1Q05682 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CALD1Q05682 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CALD1Q05682 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CALD1Q05682 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CALD1Q05682 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CALD1Q05682 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CALD1Q05682 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CALD1Q05682 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CALD1Q05682 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CALD1Q05682 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CALD1Q05682 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CALD1Q05682 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CALD1Q05682 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CALD1Q05682 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CALD1Q05682 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CALD1Q05682 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CALD1Q05682 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CALD1Q05682 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CALD1Q05682 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CALD1Q05682 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CALD1Q05682 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CALD1Q05682 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CALD1Q05682 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CALD1Q05682 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CALD1Q05682 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CALD1Q05682 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CALD1Q05682 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CALD1Q05682 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CALD1Q05682 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CALD1Q05682 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CALD1Q05682 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CALD1Q05682 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CALD1Q05682 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CALD1Q05682 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CALD1Q05682 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CALD1Q05682 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CALD1Q05682 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CALD1Q05682 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CALD1Q05682 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms