Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
ERCC6Q03468 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
ERCC6Q03468 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
ERCC6Q03468 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
ERCC6Q03468 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
ERCC6Q03468 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
ERCC6Q03468 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
ERCC6Q03468 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
ERCC6Q03468 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
ERCC6Q03468 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
ERCC6Q03468 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
ERCC6Q03468 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
ERCC6Q03468 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC33.25■■■□□ 2.91
ERCC6Q03468 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
ERCC6Q03468 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
ERCC6Q03468 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
ERCC6Q03468 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
ERCC6Q03468 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
ERCC6Q03468 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
ERCC6Q03468 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
ERCC6Q03468 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
ERCC6Q03468 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
ERCC6Q03468 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
ERCC6Q03468 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
ERCC6Q03468 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
ERCC6Q03468 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
ERCC6Q03468 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
ERCC6Q03468 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC33.24■■■□□ 2.91
ERCC6Q03468 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
ERCC6Q03468 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
ERCC6Q03468 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
ERCC6Q03468 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
ERCC6Q03468 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
ERCC6Q03468 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
ERCC6Q03468 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
ERCC6Q03468 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
ERCC6Q03468 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
ERCC6Q03468 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
ERCC6Q03468 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
ERCC6Q03468 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
ERCC6Q03468 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
ERCC6Q03468 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
ERCC6Q03468 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
ERCC6Q03468 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
ERCC6Q03468 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
ERCC6Q03468 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
ERCC6Q03468 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
ERCC6Q03468 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC33.22■■■□□ 2.91
ERCC6Q03468 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
ERCC6Q03468 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
ERCC6Q03468 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
ERCC6Q03468 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
ERCC6Q03468 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
ERCC6Q03468 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
ERCC6Q03468 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
ERCC6Q03468 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
ERCC6Q03468 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
ERCC6Q03468 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
ERCC6Q03468 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
ERCC6Q03468 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
ERCC6Q03468 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
ERCC6Q03468 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
ERCC6Q03468 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC33.21■■■□□ 2.91
ERCC6Q03468 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
ERCC6Q03468 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC33.21■■■□□ 2.91
ERCC6Q03468 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
ERCC6Q03468 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
ERCC6Q03468 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
ERCC6Q03468 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
ERCC6Q03468 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
ERCC6Q03468 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
ERCC6Q03468 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
ERCC6Q03468 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
ERCC6Q03468 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
ERCC6Q03468 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
ERCC6Q03468 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
ERCC6Q03468 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
ERCC6Q03468 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
ERCC6Q03468 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
ERCC6Q03468 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
ERCC6Q03468 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
ERCC6Q03468 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
ERCC6Q03468 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.9
ERCC6Q03468 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC33.19■■■□□ 2.9
ERCC6Q03468 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
ERCC6Q03468 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC33.19■■■□□ 2.9
ERCC6Q03468 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC33.19■■■□□ 2.9
ERCC6Q03468 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
ERCC6Q03468 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC33.19■■■□□ 2.9
ERCC6Q03468 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
ERCC6Q03468 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
ERCC6Q03468 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
ERCC6Q03468 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
ERCC6Q03468 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
ERCC6Q03468 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
ERCC6Q03468 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
ERCC6Q03468 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
ERCC6Q03468 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
ERCC6Q03468 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
ERCC6Q03468 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms