Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CDC42EP1Q00587 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDC42EP1Q00587 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDC42EP1Q00587 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CDC42EP1Q00587 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDC42EP1Q00587 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDC42EP1Q00587 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDC42EP1Q00587 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDC42EP1Q00587 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CDC42EP1Q00587 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDC42EP1Q00587 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CDC42EP1Q00587 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CDC42EP1Q00587 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDC42EP1Q00587 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDC42EP1Q00587 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDC42EP1Q00587 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDC42EP1Q00587 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDC42EP1Q00587 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDC42EP1Q00587 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDC42EP1Q00587 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDC42EP1Q00587 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDC42EP1Q00587 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDC42EP1Q00587 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDC42EP1Q00587 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDC42EP1Q00587 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDC42EP1Q00587 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDC42EP1Q00587 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDC42EP1Q00587 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDC42EP1Q00587 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDC42EP1Q00587 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDC42EP1Q00587 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDC42EP1Q00587 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDC42EP1Q00587 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDC42EP1Q00587 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDC42EP1Q00587 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDC42EP1Q00587 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CDC42EP1Q00587 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDC42EP1Q00587 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDC42EP1Q00587 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDC42EP1Q00587 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDC42EP1Q00587 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDC42EP1Q00587 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDC42EP1Q00587 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDC42EP1Q00587 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDC42EP1Q00587 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CDC42EP1Q00587 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDC42EP1Q00587 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDC42EP1Q00587 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDC42EP1Q00587 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CDC42EP1Q00587 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CDC42EP1Q00587 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CDC42EP1Q00587 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CDC42EP1Q00587 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CDC42EP1Q00587 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDC42EP1Q00587 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDC42EP1Q00587 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDC42EP1Q00587 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDC42EP1Q00587 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CDC42EP1Q00587 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDC42EP1Q00587 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDC42EP1Q00587 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDC42EP1Q00587 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CDC42EP1Q00587 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDC42EP1Q00587 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDC42EP1Q00587 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDC42EP1Q00587 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CDC42EP1Q00587 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDC42EP1Q00587 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDC42EP1Q00587 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDC42EP1Q00587 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDC42EP1Q00587 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDC42EP1Q00587 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDC42EP1Q00587 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDC42EP1Q00587 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDC42EP1Q00587 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CDC42EP1Q00587 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDC42EP1Q00587 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDC42EP1Q00587 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDC42EP1Q00587 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CDC42EP1Q00587 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDC42EP1Q00587 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDC42EP1Q00587 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDC42EP1Q00587 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDC42EP1Q00587 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDC42EP1Q00587 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDC42EP1Q00587 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDC42EP1Q00587 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDC42EP1Q00587 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDC42EP1Q00587 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDC42EP1Q00587 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDC42EP1Q00587 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDC42EP1Q00587 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDC42EP1Q00587 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDC42EP1Q00587 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDC42EP1Q00587 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDC42EP1Q00587 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDC42EP1Q00587 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDC42EP1Q00587 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDC42EP1Q00587 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDC42EP1Q00587 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms