Protein–RNA interactions for Protein: P61968

LMO4, LIM domain transcription factor LMO4, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO4P61968 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMO4P61968 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LMO4P61968 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMO4P61968 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMO4P61968 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMO4P61968 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMO4P61968 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMO4P61968 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMO4P61968 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMO4P61968 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMO4P61968 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMO4P61968 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMO4P61968 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMO4P61968 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMO4P61968 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMO4P61968 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMO4P61968 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMO4P61968 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMO4P61968 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMO4P61968 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMO4P61968 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMO4P61968 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMO4P61968 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LMO4P61968 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMO4P61968 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMO4P61968 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMO4P61968 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMO4P61968 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMO4P61968 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMO4P61968 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMO4P61968 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMO4P61968 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMO4P61968 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMO4P61968 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMO4P61968 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMO4P61968 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LMO4P61968 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMO4P61968 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMO4P61968 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMO4P61968 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMO4P61968 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMO4P61968 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LMO4P61968 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMO4P61968 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMO4P61968 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMO4P61968 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMO4P61968 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMO4P61968 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMO4P61968 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMO4P61968 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMO4P61968 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMO4P61968 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMO4P61968 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LMO4P61968 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LMO4P61968 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LMO4P61968 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LMO4P61968 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LMO4P61968 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LMO4P61968 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LMO4P61968 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LMO4P61968 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LMO4P61968 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LMO4P61968 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LMO4P61968 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LMO4P61968 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LMO4P61968 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LMO4P61968 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LMO4P61968 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LMO4P61968 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LMO4P61968 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LMO4P61968 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LMO4P61968 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LMO4P61968 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LMO4P61968 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LMO4P61968 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LMO4P61968 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LMO4P61968 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LMO4P61968 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LMO4P61968 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LMO4P61968 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LMO4P61968 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LMO4P61968 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LMO4P61968 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LMO4P61968 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LMO4P61968 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LMO4P61968 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LMO4P61968 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LMO4P61968 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LMO4P61968 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LMO4P61968 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LMO4P61968 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LMO4P61968 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LMO4P61968 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LMO4P61968 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LMO4P61968 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LMO4P61968 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LMO4P61968 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LMO4P61968 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LMO4P61968 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LMO4P61968 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms