Protein–RNA interactions for Protein: P61758

VBP1, Prefoldin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VBP1P61758 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VBP1P61758 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VBP1P61758 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VBP1P61758 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VBP1P61758 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VBP1P61758 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VBP1P61758 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VBP1P61758 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VBP1P61758 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VBP1P61758 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VBP1P61758 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VBP1P61758 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
VBP1P61758 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VBP1P61758 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VBP1P61758 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VBP1P61758 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VBP1P61758 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VBP1P61758 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VBP1P61758 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VBP1P61758 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VBP1P61758 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VBP1P61758 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
VBP1P61758 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VBP1P61758 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VBP1P61758 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VBP1P61758 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VBP1P61758 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VBP1P61758 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VBP1P61758 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VBP1P61758 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VBP1P61758 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VBP1P61758 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VBP1P61758 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VBP1P61758 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VBP1P61758 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VBP1P61758 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VBP1P61758 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VBP1P61758 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VBP1P61758 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VBP1P61758 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VBP1P61758 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VBP1P61758 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VBP1P61758 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VBP1P61758 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VBP1P61758 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VBP1P61758 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VBP1P61758 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VBP1P61758 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VBP1P61758 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VBP1P61758 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VBP1P61758 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VBP1P61758 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VBP1P61758 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VBP1P61758 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VBP1P61758 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
VBP1P61758 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VBP1P61758 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VBP1P61758 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VBP1P61758 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VBP1P61758 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VBP1P61758 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VBP1P61758 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VBP1P61758 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VBP1P61758 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VBP1P61758 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
VBP1P61758 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VBP1P61758 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VBP1P61758 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VBP1P61758 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VBP1P61758 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VBP1P61758 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VBP1P61758 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VBP1P61758 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VBP1P61758 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VBP1P61758 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
VBP1P61758 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VBP1P61758 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VBP1P61758 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VBP1P61758 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VBP1P61758 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VBP1P61758 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VBP1P61758 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VBP1P61758 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VBP1P61758 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VBP1P61758 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VBP1P61758 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VBP1P61758 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VBP1P61758 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VBP1P61758 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VBP1P61758 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VBP1P61758 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VBP1P61758 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VBP1P61758 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
VBP1P61758 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VBP1P61758 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VBP1P61758 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VBP1P61758 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
VBP1P61758 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VBP1P61758 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VBP1P61758 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms