Protein–RNA interactions for Protein: P53367

ARFIP1, Arfaptin-1, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFIP1P53367 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARFIP1P53367 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARFIP1P53367 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARFIP1P53367 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARFIP1P53367 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARFIP1P53367 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ARFIP1P53367 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARFIP1P53367 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARFIP1P53367 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARFIP1P53367 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARFIP1P53367 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARFIP1P53367 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARFIP1P53367 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARFIP1P53367 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARFIP1P53367 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARFIP1P53367 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARFIP1P53367 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARFIP1P53367 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARFIP1P53367 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARFIP1P53367 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARFIP1P53367 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARFIP1P53367 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARFIP1P53367 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARFIP1P53367 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARFIP1P53367 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARFIP1P53367 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARFIP1P53367 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARFIP1P53367 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ARFIP1P53367 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ARFIP1P53367 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARFIP1P53367 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARFIP1P53367 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARFIP1P53367 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARFIP1P53367 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARFIP1P53367 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARFIP1P53367 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARFIP1P53367 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARFIP1P53367 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARFIP1P53367 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARFIP1P53367 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARFIP1P53367 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARFIP1P53367 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARFIP1P53367 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARFIP1P53367 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARFIP1P53367 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARFIP1P53367 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARFIP1P53367 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARFIP1P53367 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARFIP1P53367 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARFIP1P53367 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARFIP1P53367 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARFIP1P53367 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARFIP1P53367 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARFIP1P53367 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARFIP1P53367 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARFIP1P53367 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARFIP1P53367 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARFIP1P53367 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARFIP1P53367 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARFIP1P53367 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARFIP1P53367 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARFIP1P53367 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARFIP1P53367 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARFIP1P53367 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARFIP1P53367 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARFIP1P53367 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ARFIP1P53367 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARFIP1P53367 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARFIP1P53367 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARFIP1P53367 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARFIP1P53367 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARFIP1P53367 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARFIP1P53367 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARFIP1P53367 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARFIP1P53367 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARFIP1P53367 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARFIP1P53367 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARFIP1P53367 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARFIP1P53367 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARFIP1P53367 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARFIP1P53367 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARFIP1P53367 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARFIP1P53367 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARFIP1P53367 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARFIP1P53367 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARFIP1P53367 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARFIP1P53367 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARFIP1P53367 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARFIP1P53367 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARFIP1P53367 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARFIP1P53367 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARFIP1P53367 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARFIP1P53367 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARFIP1P53367 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARFIP1P53367 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARFIP1P53367 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARFIP1P53367 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARFIP1P53367 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARFIP1P53367 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARFIP1P53367 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms