Protein–RNA interactions for Protein: P52657

GTF2A2, Transcription initiation factor IIA subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A2P52657 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GTF2A2P52657 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GTF2A2P52657 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
GTF2A2P52657 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
GTF2A2P52657 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GTF2A2P52657 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GTF2A2P52657 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GTF2A2P52657 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GTF2A2P52657 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GTF2A2P52657 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF2A2P52657 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF2A2P52657 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF2A2P52657 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF2A2P52657 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF2A2P52657 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF2A2P52657 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF2A2P52657 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF2A2P52657 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF2A2P52657 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF2A2P52657 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF2A2P52657 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF2A2P52657 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF2A2P52657 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF2A2P52657 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF2A2P52657 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF2A2P52657 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF2A2P52657 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF2A2P52657 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF2A2P52657 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF2A2P52657 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF2A2P52657 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF2A2P52657 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF2A2P52657 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF2A2P52657 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF2A2P52657 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF2A2P52657 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF2A2P52657 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF2A2P52657 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF2A2P52657 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF2A2P52657 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF2A2P52657 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF2A2P52657 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF2A2P52657 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF2A2P52657 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF2A2P52657 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF2A2P52657 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF2A2P52657 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF2A2P52657 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF2A2P52657 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF2A2P52657 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF2A2P52657 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF2A2P52657 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF2A2P52657 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF2A2P52657 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF2A2P52657 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF2A2P52657 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF2A2P52657 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF2A2P52657 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2A2P52657 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2A2P52657 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2A2P52657 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2A2P52657 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2A2P52657 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2A2P52657 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2A2P52657 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2A2P52657 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2A2P52657 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2A2P52657 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2A2P52657 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2A2P52657 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2A2P52657 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2A2P52657 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF2A2P52657 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF2A2P52657 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF2A2P52657 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF2A2P52657 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF2A2P52657 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF2A2P52657 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF2A2P52657 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF2A2P52657 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF2A2P52657 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF2A2P52657 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF2A2P52657 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF2A2P52657 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF2A2P52657 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF2A2P52657 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF2A2P52657 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF2A2P52657 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF2A2P52657 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF2A2P52657 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF2A2P52657 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF2A2P52657 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF2A2P52657 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF2A2P52657 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF2A2P52657 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF2A2P52657 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF2A2P52657 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF2A2P52657 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF2A2P52657 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF2A2P52657 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms