Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ME1P48163 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ME1P48163 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ME1P48163 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ME1P48163 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ME1P48163 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ME1P48163 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ME1P48163 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ME1P48163 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ME1P48163 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ME1P48163 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ME1P48163 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ME1P48163 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ME1P48163 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ME1P48163 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ME1P48163 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ME1P48163 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ME1P48163 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ME1P48163 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ME1P48163 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ME1P48163 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ME1P48163 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ME1P48163 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ME1P48163 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ME1P48163 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ME1P48163 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ME1P48163 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ME1P48163 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ME1P48163 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ME1P48163 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ME1P48163 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ME1P48163 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ME1P48163 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ME1P48163 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ME1P48163 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ME1P48163 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ME1P48163 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ME1P48163 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ME1P48163 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ME1P48163 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ME1P48163 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ME1P48163 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ME1P48163 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ME1P48163 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ME1P48163 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ME1P48163 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ME1P48163 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ME1P48163 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ME1P48163 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ME1P48163 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ME1P48163 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ME1P48163 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ME1P48163 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
ME1P48163 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ME1P48163 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ME1P48163 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ME1P48163 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ME1P48163 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ME1P48163 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ME1P48163 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ME1P48163 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ME1P48163 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ME1P48163 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ME1P48163 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ME1P48163 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ME1P48163 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ME1P48163 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ME1P48163 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ME1P48163 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ME1P48163 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ME1P48163 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ME1P48163 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ME1P48163 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ME1P48163 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ME1P48163 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ME1P48163 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ME1P48163 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ME1P48163 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ME1P48163 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ME1P48163 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ME1P48163 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ME1P48163 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ME1P48163 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ME1P48163 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ME1P48163 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ME1P48163 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ME1P48163 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ME1P48163 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ME1P48163 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ME1P48163 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ME1P48163 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ME1P48163 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ME1P48163 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ME1P48163 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ME1P48163 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ME1P48163 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ME1P48163 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ME1P48163 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ME1P48163 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ME1P48163 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms