Protein–RNA interactions for Protein: P33897

ABCD1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD1P33897 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ABCD1P33897 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ABCD1P33897 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ABCD1P33897 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ABCD1P33897 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ABCD1P33897 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ABCD1P33897 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ABCD1P33897 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ABCD1P33897 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ABCD1P33897 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ABCD1P33897 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ABCD1P33897 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ABCD1P33897 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ABCD1P33897 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ABCD1P33897 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ABCD1P33897 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ABCD1P33897 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ABCD1P33897 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ABCD1P33897 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ABCD1P33897 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ABCD1P33897 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ABCD1P33897 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ABCD1P33897 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ABCD1P33897 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ABCD1P33897 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ABCD1P33897 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ABCD1P33897 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ABCD1P33897 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ABCD1P33897 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ABCD1P33897 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ABCD1P33897 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ABCD1P33897 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ABCD1P33897 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ABCD1P33897 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ABCD1P33897 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ABCD1P33897 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ABCD1P33897 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ABCD1P33897 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ABCD1P33897 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ABCD1P33897 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ABCD1P33897 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ABCD1P33897 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ABCD1P33897 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ABCD1P33897 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ABCD1P33897 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ABCD1P33897 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ABCD1P33897 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ABCD1P33897 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ABCD1P33897 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ABCD1P33897 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ABCD1P33897 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ABCD1P33897 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ABCD1P33897 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ABCD1P33897 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
ABCD1P33897 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
ABCD1P33897 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ABCD1P33897 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ABCD1P33897 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ABCD1P33897 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ABCD1P33897 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ABCD1P33897 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ABCD1P33897 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ABCD1P33897 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ABCD1P33897 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ABCD1P33897 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ABCD1P33897 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ABCD1P33897 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ABCD1P33897 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ABCD1P33897 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ABCD1P33897 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ABCD1P33897 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ABCD1P33897 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ABCD1P33897 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ABCD1P33897 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ABCD1P33897 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ABCD1P33897 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ABCD1P33897 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ABCD1P33897 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ABCD1P33897 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ABCD1P33897 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ABCD1P33897 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ABCD1P33897 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ABCD1P33897 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ABCD1P33897 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ABCD1P33897 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ABCD1P33897 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ABCD1P33897 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ABCD1P33897 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ABCD1P33897 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ABCD1P33897 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ABCD1P33897 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ABCD1P33897 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ABCD1P33897 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ABCD1P33897 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ABCD1P33897 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ABCD1P33897 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ABCD1P33897 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ABCD1P33897 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ABCD1P33897 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ABCD1P33897 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms