Protein–RNA interactions for Protein: P29376

LTK, Leukocyte tyrosine kinase receptor, humanhuman

Predictions only

Length 864 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTKP29376 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC27.55■■■□□ 2
LTKP29376 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
LTKP29376 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LTKP29376 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LTKP29376 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LTKP29376 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LTKP29376 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
LTKP29376 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LTKP29376 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
LTKP29376 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LTKP29376 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
LTKP29376 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LTKP29376 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
LTKP29376 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
LTKP29376 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
LTKP29376 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
LTKP29376 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
LTKP29376 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
LTKP29376 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC27.53■■■□□ 2
LTKP29376 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC27.53■■■□□ 2
LTKP29376 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
LTKP29376 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC27.53■■■□□ 2
LTKP29376 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LTKP29376 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
LTKP29376 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC27.53■■■□□ 2
LTKP29376 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
LTKP29376 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LTKP29376 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LTKP29376 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
LTKP29376 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LTKP29376 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LTKP29376 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
LTKP29376 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LTKP29376 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LTKP29376 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
LTKP29376 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LTKP29376 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LTKP29376 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LTKP29376 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC27.52■■■□□ 2
LTKP29376 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
LTKP29376 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
LTKP29376 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
LTKP29376 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC27.52■■■□□ 2
LTKP29376 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
LTKP29376 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC27.52■■■□□ 2
LTKP29376 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
LTKP29376 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LTKP29376 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LTKP29376 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LTKP29376 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
LTKP29376 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LTKP29376 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LTKP29376 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LTKP29376 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LTKP29376 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LTKP29376 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
LTKP29376 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LTKP29376 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LTKP29376 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LTKP29376 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LTKP29376 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LTKP29376 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LTKP29376 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LTKP29376 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LTKP29376 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LTKP29376 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LTKP29376 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LTKP29376 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LTKP29376 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LTKP29376 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LTKP29376 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LTKP29376 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LTKP29376 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LTKP29376 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
LTKP29376 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LTKP29376 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LTKP29376 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
LTKP29376 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LTKP29376 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LTKP29376 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LTKP29376 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LTKP29376 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LTKP29376 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LTKP29376 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LTKP29376 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LTKP29376 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LTKP29376 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LTKP29376 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LTKP29376 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LTKP29376 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LTKP29376 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LTKP29376 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
LTKP29376 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LTKP29376 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LTKP29376 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LTKP29376 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LTKP29376 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LTKP29376 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LTKP29376 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LTKP29376 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms