Protein–RNA interactions for Protein: P25490

YY1, Transcriptional repressor protein YY1, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YY1P25490 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
YY1P25490 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
YY1P25490 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
YY1P25490 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
YY1P25490 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
YY1P25490 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
YY1P25490 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
YY1P25490 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
YY1P25490 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
YY1P25490 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
YY1P25490 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
YY1P25490 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
YY1P25490 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
YY1P25490 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
YY1P25490 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
YY1P25490 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
YY1P25490 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
YY1P25490 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
YY1P25490 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
YY1P25490 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
YY1P25490 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
YY1P25490 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
YY1P25490 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
YY1P25490 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
YY1P25490 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
YY1P25490 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
YY1P25490 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
YY1P25490 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
YY1P25490 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
YY1P25490 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
YY1P25490 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
YY1P25490 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
YY1P25490 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
YY1P25490 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
YY1P25490 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
YY1P25490 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
YY1P25490 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
YY1P25490 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
YY1P25490 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
YY1P25490 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
YY1P25490 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
YY1P25490 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
YY1P25490 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
YY1P25490 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
YY1P25490 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
YY1P25490 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
YY1P25490 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
YY1P25490 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
YY1P25490 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
YY1P25490 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
YY1P25490 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
YY1P25490 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
YY1P25490 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
YY1P25490 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
YY1P25490 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
YY1P25490 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
YY1P25490 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
YY1P25490 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
YY1P25490 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
YY1P25490 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
YY1P25490 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
YY1P25490 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
YY1P25490 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
YY1P25490 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
YY1P25490 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
YY1P25490 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
YY1P25490 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
YY1P25490 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
YY1P25490 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
YY1P25490 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
YY1P25490 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
YY1P25490 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
YY1P25490 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
YY1P25490 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
YY1P25490 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
YY1P25490 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
YY1P25490 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
YY1P25490 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
YY1P25490 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
YY1P25490 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
YY1P25490 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
YY1P25490 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
YY1P25490 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
YY1P25490 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
YY1P25490 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
YY1P25490 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
YY1P25490 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
YY1P25490 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
YY1P25490 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
YY1P25490 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
YY1P25490 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
YY1P25490 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
YY1P25490 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
YY1P25490 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
YY1P25490 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
YY1P25490 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
YY1P25490 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
YY1P25490 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
YY1P25490 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
YY1P25490 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms