Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ACTN1P12814 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ACTN1P12814 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ACTN1P12814 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ACTN1P12814 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ACTN1P12814 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ACTN1P12814 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ACTN1P12814 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ACTN1P12814 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ACTN1P12814 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ACTN1P12814 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ACTN1P12814 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ACTN1P12814 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ACTN1P12814 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ACTN1P12814 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ACTN1P12814 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ACTN1P12814 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ACTN1P12814 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ACTN1P12814 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ACTN1P12814 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ACTN1P12814 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ACTN1P12814 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ACTN1P12814 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ACTN1P12814 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ACTN1P12814 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ACTN1P12814 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ACTN1P12814 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ACTN1P12814 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ACTN1P12814 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ACTN1P12814 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ACTN1P12814 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ACTN1P12814 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ACTN1P12814 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ACTN1P12814 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ACTN1P12814 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ACTN1P12814 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ACTN1P12814 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ACTN1P12814 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ACTN1P12814 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ACTN1P12814 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ACTN1P12814 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ACTN1P12814 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ACTN1P12814 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ACTN1P12814 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ACTN1P12814 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ACTN1P12814 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ACTN1P12814 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ACTN1P12814 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ACTN1P12814 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ACTN1P12814 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ACTN1P12814 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ACTN1P12814 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ACTN1P12814 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ACTN1P12814 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ACTN1P12814 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ACTN1P12814 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ACTN1P12814 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ACTN1P12814 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ACTN1P12814 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ACTN1P12814 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACTN1P12814 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACTN1P12814 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACTN1P12814 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACTN1P12814 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACTN1P12814 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACTN1P12814 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACTN1P12814 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACTN1P12814 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACTN1P12814 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACTN1P12814 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACTN1P12814 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACTN1P12814 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACTN1P12814 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACTN1P12814 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACTN1P12814 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACTN1P12814 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACTN1P12814 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACTN1P12814 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
ACTN1P12814 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
ACTN1P12814 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ACTN1P12814 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ACTN1P12814 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ACTN1P12814 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ACTN1P12814 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ACTN1P12814 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ACTN1P12814 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ACTN1P12814 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ACTN1P12814 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ACTN1P12814 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ACTN1P12814 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ACTN1P12814 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ACTN1P12814 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ACTN1P12814 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ACTN1P12814 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ACTN1P12814 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ACTN1P12814 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ACTN1P12814 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ACTN1P12814 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ACTN1P12814 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ACTN1P12814 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms