Protein–RNA interactions for Protein: P0DJH9

RD3L, Protein RD3-like, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RD3LP0DJH9 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RD3LP0DJH9 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RD3LP0DJH9 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RD3LP0DJH9 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RD3LP0DJH9 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RD3LP0DJH9 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RD3LP0DJH9 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RD3LP0DJH9 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RD3LP0DJH9 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RD3LP0DJH9 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RD3LP0DJH9 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RD3LP0DJH9 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RD3LP0DJH9 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RD3LP0DJH9 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RD3LP0DJH9 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RD3LP0DJH9 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RD3LP0DJH9 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RD3LP0DJH9 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RD3LP0DJH9 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RD3LP0DJH9 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RD3LP0DJH9 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RD3LP0DJH9 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RD3LP0DJH9 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RD3LP0DJH9 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RD3LP0DJH9 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RD3LP0DJH9 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RD3LP0DJH9 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RD3LP0DJH9 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RD3LP0DJH9 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RD3LP0DJH9 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RD3LP0DJH9 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RD3LP0DJH9 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RD3LP0DJH9 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RD3LP0DJH9 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RD3LP0DJH9 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RD3LP0DJH9 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RD3LP0DJH9 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RD3LP0DJH9 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RD3LP0DJH9 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RD3LP0DJH9 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RD3LP0DJH9 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RD3LP0DJH9 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RD3LP0DJH9 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
RD3LP0DJH9 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RD3LP0DJH9 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RD3LP0DJH9 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RD3LP0DJH9 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RD3LP0DJH9 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RD3LP0DJH9 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RD3LP0DJH9 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RD3LP0DJH9 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RD3LP0DJH9 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RD3LP0DJH9 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RD3LP0DJH9 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RD3LP0DJH9 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RD3LP0DJH9 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RD3LP0DJH9 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RD3LP0DJH9 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RD3LP0DJH9 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RD3LP0DJH9 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RD3LP0DJH9 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RD3LP0DJH9 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RD3LP0DJH9 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RD3LP0DJH9 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RD3LP0DJH9 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RD3LP0DJH9 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RD3LP0DJH9 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RD3LP0DJH9 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RD3LP0DJH9 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RD3LP0DJH9 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RD3LP0DJH9 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RD3LP0DJH9 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RD3LP0DJH9 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RD3LP0DJH9 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RD3LP0DJH9 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RD3LP0DJH9 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RD3LP0DJH9 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RD3LP0DJH9 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RD3LP0DJH9 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RD3LP0DJH9 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RD3LP0DJH9 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RD3LP0DJH9 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RD3LP0DJH9 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RD3LP0DJH9 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RD3LP0DJH9 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RD3LP0DJH9 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RD3LP0DJH9 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RD3LP0DJH9 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RD3LP0DJH9 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RD3LP0DJH9 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RD3LP0DJH9 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RD3LP0DJH9 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RD3LP0DJH9 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RD3LP0DJH9 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RD3LP0DJH9 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RD3LP0DJH9 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RD3LP0DJH9 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RD3LP0DJH9 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RD3LP0DJH9 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RD3LP0DJH9 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms