Protein–RNA interactions for Protein: P09238

MMP10, Stromelysin-2, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP10P09238 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MMP10P09238 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MMP10P09238 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MMP10P09238 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MMP10P09238 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MMP10P09238 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MMP10P09238 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MMP10P09238 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MMP10P09238 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
MMP10P09238 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MMP10P09238 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MMP10P09238 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MMP10P09238 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MMP10P09238 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MMP10P09238 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MMP10P09238 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MMP10P09238 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MMP10P09238 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MMP10P09238 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MMP10P09238 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MMP10P09238 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MMP10P09238 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MMP10P09238 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MMP10P09238 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MMP10P09238 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MMP10P09238 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MMP10P09238 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MMP10P09238 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
MMP10P09238 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MMP10P09238 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MMP10P09238 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MMP10P09238 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MMP10P09238 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MMP10P09238 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MMP10P09238 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MMP10P09238 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MMP10P09238 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MMP10P09238 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MMP10P09238 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MMP10P09238 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MMP10P09238 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MMP10P09238 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
MMP10P09238 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MMP10P09238 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MMP10P09238 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MMP10P09238 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MMP10P09238 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MMP10P09238 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MMP10P09238 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MMP10P09238 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MMP10P09238 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MMP10P09238 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MMP10P09238 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MMP10P09238 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MMP10P09238 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MMP10P09238 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
MMP10P09238 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MMP10P09238 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MMP10P09238 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MMP10P09238 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MMP10P09238 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MMP10P09238 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
MMP10P09238 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MMP10P09238 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MMP10P09238 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MMP10P09238 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MMP10P09238 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MMP10P09238 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MMP10P09238 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MMP10P09238 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
MMP10P09238 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MMP10P09238 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MMP10P09238 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MMP10P09238 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MMP10P09238 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MMP10P09238 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MMP10P09238 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MMP10P09238 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MMP10P09238 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
MMP10P09238 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MMP10P09238 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MMP10P09238 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
MMP10P09238 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
MMP10P09238 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MMP10P09238 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MMP10P09238 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MMP10P09238 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MMP10P09238 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MMP10P09238 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MMP10P09238 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MMP10P09238 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MMP10P09238 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MMP10P09238 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
MMP10P09238 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MMP10P09238 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MMP10P09238 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MMP10P09238 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MMP10P09238 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MMP10P09238 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MMP10P09238 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms