Protein–RNA interactions for Protein: P07195

LDHB, L-lactate dehydrogenase B chain, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDHBP07195 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LDHBP07195 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LDHBP07195 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LDHBP07195 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LDHBP07195 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LDHBP07195 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LDHBP07195 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LDHBP07195 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LDHBP07195 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LDHBP07195 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LDHBP07195 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LDHBP07195 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LDHBP07195 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LDHBP07195 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LDHBP07195 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LDHBP07195 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LDHBP07195 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LDHBP07195 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LDHBP07195 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LDHBP07195 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
LDHBP07195 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LDHBP07195 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LDHBP07195 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LDHBP07195 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LDHBP07195 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LDHBP07195 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
LDHBP07195 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LDHBP07195 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LDHBP07195 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LDHBP07195 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LDHBP07195 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LDHBP07195 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LDHBP07195 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LDHBP07195 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LDHBP07195 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LDHBP07195 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LDHBP07195 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LDHBP07195 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LDHBP07195 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LDHBP07195 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LDHBP07195 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LDHBP07195 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LDHBP07195 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LDHBP07195 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LDHBP07195 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LDHBP07195 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LDHBP07195 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LDHBP07195 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LDHBP07195 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
LDHBP07195 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
LDHBP07195 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LDHBP07195 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LDHBP07195 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LDHBP07195 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LDHBP07195 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LDHBP07195 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LDHBP07195 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LDHBP07195 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LDHBP07195 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LDHBP07195 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LDHBP07195 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LDHBP07195 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LDHBP07195 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LDHBP07195 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LDHBP07195 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LDHBP07195 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LDHBP07195 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
LDHBP07195 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LDHBP07195 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LDHBP07195 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LDHBP07195 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LDHBP07195 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LDHBP07195 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LDHBP07195 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LDHBP07195 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LDHBP07195 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LDHBP07195 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LDHBP07195 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LDHBP07195 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
LDHBP07195 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
LDHBP07195 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LDHBP07195 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LDHBP07195 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LDHBP07195 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LDHBP07195 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LDHBP07195 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LDHBP07195 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LDHBP07195 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LDHBP07195 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LDHBP07195 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LDHBP07195 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LDHBP07195 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
LDHBP07195 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LDHBP07195 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LDHBP07195 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LDHBP07195 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LDHBP07195 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LDHBP07195 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LDHBP07195 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LDHBP07195 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms