Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SKAP2O75563 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SKAP2O75563 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SKAP2O75563 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SKAP2O75563 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SKAP2O75563 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SKAP2O75563 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SKAP2O75563 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SKAP2O75563 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SKAP2O75563 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SKAP2O75563 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SKAP2O75563 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SKAP2O75563 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SKAP2O75563 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SKAP2O75563 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SKAP2O75563 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SKAP2O75563 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SKAP2O75563 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SKAP2O75563 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SKAP2O75563 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SKAP2O75563 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SKAP2O75563 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SKAP2O75563 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SKAP2O75563 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SKAP2O75563 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SKAP2O75563 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SKAP2O75563 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SKAP2O75563 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SKAP2O75563 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SKAP2O75563 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SKAP2O75563 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SKAP2O75563 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SKAP2O75563 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SKAP2O75563 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SKAP2O75563 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SKAP2O75563 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SKAP2O75563 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SKAP2O75563 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SKAP2O75563 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SKAP2O75563 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SKAP2O75563 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SKAP2O75563 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SKAP2O75563 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SKAP2O75563 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SKAP2O75563 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SKAP2O75563 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SKAP2O75563 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SKAP2O75563 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SKAP2O75563 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SKAP2O75563 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SKAP2O75563 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SKAP2O75563 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SKAP2O75563 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SKAP2O75563 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SKAP2O75563 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SKAP2O75563 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SKAP2O75563 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SKAP2O75563 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SKAP2O75563 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SKAP2O75563 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SKAP2O75563 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SKAP2O75563 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SKAP2O75563 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SKAP2O75563 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SKAP2O75563 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SKAP2O75563 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SKAP2O75563 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SKAP2O75563 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SKAP2O75563 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SKAP2O75563 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SKAP2O75563 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SKAP2O75563 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SKAP2O75563 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SKAP2O75563 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SKAP2O75563 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SKAP2O75563 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SKAP2O75563 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SKAP2O75563 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SKAP2O75563 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SKAP2O75563 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SKAP2O75563 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SKAP2O75563 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SKAP2O75563 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SKAP2O75563 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SKAP2O75563 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SKAP2O75563 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SKAP2O75563 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SKAP2O75563 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SKAP2O75563 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SKAP2O75563 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SKAP2O75563 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SKAP2O75563 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SKAP2O75563 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SKAP2O75563 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SKAP2O75563 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SKAP2O75563 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SKAP2O75563 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SKAP2O75563 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SKAP2O75563 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SKAP2O75563 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms