Protein–RNA interactions for Protein: O60303

KIAA0556, Protein KIAA0556, humanhuman

Predictions only

Length 1,618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA0556O60303 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
KIAA0556O60303 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
KIAA0556O60303 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
KIAA0556O60303 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
KIAA0556O60303 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
KIAA0556O60303 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
KIAA0556O60303 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
KIAA0556O60303 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
KIAA0556O60303 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC30.66■■■□□ 2.5
KIAA0556O60303 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC30.66■■■□□ 2.5
KIAA0556O60303 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC30.66■■■□□ 2.5
KIAA0556O60303 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.66■■■□□ 2.5
KIAA0556O60303 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
KIAA0556O60303 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
KIAA0556O60303 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
KIAA0556O60303 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
KIAA0556O60303 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
KIAA0556O60303 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
KIAA0556O60303 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
KIAA0556O60303 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC30.65■■■□□ 2.5
KIAA0556O60303 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC30.65■■■□□ 2.5
KIAA0556O60303 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
KIAA0556O60303 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
KIAA0556O60303 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
KIAA0556O60303 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
KIAA0556O60303 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
KIAA0556O60303 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
KIAA0556O60303 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
KIAA0556O60303 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.65■■■□□ 2.5
KIAA0556O60303 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
KIAA0556O60303 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
KIAA0556O60303 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
KIAA0556O60303 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
KIAA0556O60303 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
KIAA0556O60303 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
KIAA0556O60303 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
KIAA0556O60303 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
KIAA0556O60303 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
KIAA0556O60303 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
KIAA0556O60303 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
KIAA0556O60303 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
KIAA0556O60303 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
KIAA0556O60303 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
KIAA0556O60303 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC30.64■■■□□ 2.5
KIAA0556O60303 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC30.64■■■□□ 2.5
KIAA0556O60303 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
KIAA0556O60303 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
KIAA0556O60303 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
KIAA0556O60303 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
KIAA0556O60303 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.63■■■□□ 2.49
KIAA0556O60303 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
KIAA0556O60303 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
KIAA0556O60303 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
KIAA0556O60303 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
KIAA0556O60303 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
KIAA0556O60303 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC30.63■■■□□ 2.49
KIAA0556O60303 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
KIAA0556O60303 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
KIAA0556O60303 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
KIAA0556O60303 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
KIAA0556O60303 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
KIAA0556O60303 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
KIAA0556O60303 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
KIAA0556O60303 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
KIAA0556O60303 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
KIAA0556O60303 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
KIAA0556O60303 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
KIAA0556O60303 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC30.62■■■□□ 2.49
KIAA0556O60303 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
KIAA0556O60303 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
KIAA0556O60303 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
KIAA0556O60303 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
KIAA0556O60303 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC30.62■■■□□ 2.49
KIAA0556O60303 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
KIAA0556O60303 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC30.62■■■□□ 2.49
KIAA0556O60303 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
KIAA0556O60303 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
KIAA0556O60303 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
KIAA0556O60303 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
KIAA0556O60303 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
KIAA0556O60303 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
KIAA0556O60303 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
KIAA0556O60303 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
KIAA0556O60303 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
KIAA0556O60303 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
KIAA0556O60303 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
KIAA0556O60303 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
KIAA0556O60303 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
KIAA0556O60303 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
KIAA0556O60303 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC30.61■■■□□ 2.49
KIAA0556O60303 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
KIAA0556O60303 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
KIAA0556O60303 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
KIAA0556O60303 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
KIAA0556O60303 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC30.61■■■□□ 2.49
KIAA0556O60303 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
KIAA0556O60303 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
KIAA0556O60303 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC30.6■■■□□ 2.49
KIAA0556O60303 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
KIAA0556O60303 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms