Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SYNMO15061 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SYNMO15061 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SYNMO15061 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SYNMO15061 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SYNMO15061 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SYNMO15061 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SYNMO15061 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SYNMO15061 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SYNMO15061 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
SYNMO15061 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SYNMO15061 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SYNMO15061 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SYNMO15061 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SYNMO15061 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SYNMO15061 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SYNMO15061 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SYNMO15061 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SYNMO15061 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SYNMO15061 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SYNMO15061 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SYNMO15061 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SYNMO15061 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SYNMO15061 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SYNMO15061 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SYNMO15061 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
SYNMO15061 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SYNMO15061 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
SYNMO15061 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SYNMO15061 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SYNMO15061 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SYNMO15061 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SYNMO15061 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SYNMO15061 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SYNMO15061 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SYNMO15061 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SYNMO15061 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SYNMO15061 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
SYNMO15061 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
SYNMO15061 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SYNMO15061 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SYNMO15061 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SYNMO15061 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
SYNMO15061 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SYNMO15061 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SYNMO15061 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SYNMO15061 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
SYNMO15061 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
SYNMO15061 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SYNMO15061 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SYNMO15061 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SYNMO15061 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SYNMO15061 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SYNMO15061 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SYNMO15061 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SYNMO15061 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SYNMO15061 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SYNMO15061 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SYNMO15061 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SYNMO15061 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SYNMO15061 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SYNMO15061 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SYNMO15061 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SYNMO15061 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
SYNMO15061 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SYNMO15061 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
SYNMO15061 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SYNMO15061 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SYNMO15061 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SYNMO15061 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SYNMO15061 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SYNMO15061 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SYNMO15061 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SYNMO15061 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SYNMO15061 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SYNMO15061 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SYNMO15061 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SYNMO15061 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SYNMO15061 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SYNMO15061 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SYNMO15061 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SYNMO15061 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SYNMO15061 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SYNMO15061 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SYNMO15061 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SYNMO15061 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SYNMO15061 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SYNMO15061 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SYNMO15061 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SYNMO15061 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SYNMO15061 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SYNMO15061 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SYNMO15061 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SYNMO15061 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SYNMO15061 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SYNMO15061 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SYNMO15061 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SYNMO15061 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SYNMO15061 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SYNMO15061 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms