Protein–RNA interactions for Protein: O00161

SNAP23, Synaptosomal-associated protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP23O00161 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNAP23O00161 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNAP23O00161 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNAP23O00161 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNAP23O00161 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNAP23O00161 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNAP23O00161 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNAP23O00161 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNAP23O00161 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNAP23O00161 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNAP23O00161 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SNAP23O00161 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNAP23O00161 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNAP23O00161 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNAP23O00161 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNAP23O00161 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNAP23O00161 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNAP23O00161 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNAP23O00161 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNAP23O00161 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNAP23O00161 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNAP23O00161 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNAP23O00161 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNAP23O00161 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNAP23O00161 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNAP23O00161 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNAP23O00161 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNAP23O00161 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNAP23O00161 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNAP23O00161 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNAP23O00161 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNAP23O00161 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNAP23O00161 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNAP23O00161 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNAP23O00161 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNAP23O00161 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNAP23O00161 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNAP23O00161 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNAP23O00161 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SNAP23O00161 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNAP23O00161 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNAP23O00161 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNAP23O00161 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNAP23O00161 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNAP23O00161 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNAP23O00161 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNAP23O00161 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNAP23O00161 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNAP23O00161 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNAP23O00161 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNAP23O00161 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNAP23O00161 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNAP23O00161 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNAP23O00161 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNAP23O00161 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SNAP23O00161 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SNAP23O00161 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SNAP23O00161 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SNAP23O00161 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SNAP23O00161 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SNAP23O00161 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SNAP23O00161 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SNAP23O00161 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SNAP23O00161 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SNAP23O00161 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SNAP23O00161 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SNAP23O00161 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SNAP23O00161 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SNAP23O00161 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SNAP23O00161 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SNAP23O00161 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SNAP23O00161 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SNAP23O00161 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SNAP23O00161 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SNAP23O00161 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SNAP23O00161 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SNAP23O00161 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SNAP23O00161 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SNAP23O00161 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SNAP23O00161 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNAP23O00161 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNAP23O00161 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNAP23O00161 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNAP23O00161 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNAP23O00161 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNAP23O00161 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNAP23O00161 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNAP23O00161 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNAP23O00161 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNAP23O00161 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNAP23O00161 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNAP23O00161 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNAP23O00161 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SNAP23O00161 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNAP23O00161 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNAP23O00161 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNAP23O00161 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNAP23O00161 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNAP23O00161 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNAP23O00161 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms