Protein–RNA interactions for Protein: G3X9M3

Hmgxb3, HMG box domain-containing 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgxb3G3X9M3 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Hmgxb3G3X9M3 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hmgxb3G3X9M3 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hmgxb3G3X9M3 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hmgxb3G3X9M3 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hmgxb3G3X9M3 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Hmgxb3G3X9M3 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Hmgxb3G3X9M3 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Hmgxb3G3X9M3 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Hmgxb3G3X9M3 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hmgxb3G3X9M3 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hmgxb3G3X9M3 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Hmgxb3G3X9M3 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hmgxb3G3X9M3 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hmgxb3G3X9M3 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hmgxb3G3X9M3 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hmgxb3G3X9M3 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hmgxb3G3X9M3 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hmgxb3G3X9M3 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hmgxb3G3X9M3 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hmgxb3G3X9M3 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hmgxb3G3X9M3 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hmgxb3G3X9M3 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hmgxb3G3X9M3 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Hmgxb3G3X9M3 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hmgxb3G3X9M3 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hmgxb3G3X9M3 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hmgxb3G3X9M3 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hmgxb3G3X9M3 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hmgxb3G3X9M3 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hmgxb3G3X9M3 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hmgxb3G3X9M3 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hmgxb3G3X9M3 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hmgxb3G3X9M3 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hmgxb3G3X9M3 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hmgxb3G3X9M3 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hmgxb3G3X9M3 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hmgxb3G3X9M3 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hmgxb3G3X9M3 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hmgxb3G3X9M3 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hmgxb3G3X9M3 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Hmgxb3G3X9M3 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hmgxb3G3X9M3 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hmgxb3G3X9M3 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hmgxb3G3X9M3 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hmgxb3G3X9M3 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hmgxb3G3X9M3 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hmgxb3G3X9M3 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hmgxb3G3X9M3 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hmgxb3G3X9M3 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hmgxb3G3X9M3 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hmgxb3G3X9M3 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hmgxb3G3X9M3 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hmgxb3G3X9M3 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Hmgxb3G3X9M3 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hmgxb3G3X9M3 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hmgxb3G3X9M3 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hmgxb3G3X9M3 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hmgxb3G3X9M3 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hmgxb3G3X9M3 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hmgxb3G3X9M3 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hmgxb3G3X9M3 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hmgxb3G3X9M3 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hmgxb3G3X9M3 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hmgxb3G3X9M3 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Hmgxb3G3X9M3 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hmgxb3G3X9M3 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hmgxb3G3X9M3 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Hmgxb3G3X9M3 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hmgxb3G3X9M3 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hmgxb3G3X9M3 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hmgxb3G3X9M3 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hmgxb3G3X9M3 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hmgxb3G3X9M3 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hmgxb3G3X9M3 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hmgxb3G3X9M3 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hmgxb3G3X9M3 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hmgxb3G3X9M3 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hmgxb3G3X9M3 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hmgxb3G3X9M3 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hmgxb3G3X9M3 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hmgxb3G3X9M3 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hmgxb3G3X9M3 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hmgxb3G3X9M3 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hmgxb3G3X9M3 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hmgxb3G3X9M3 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hmgxb3G3X9M3 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hmgxb3G3X9M3 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hmgxb3G3X9M3 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hmgxb3G3X9M3 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hmgxb3G3X9M3 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hmgxb3G3X9M3 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hmgxb3G3X9M3 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hmgxb3G3X9M3 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hmgxb3G3X9M3 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hmgxb3G3X9M3 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hmgxb3G3X9M3 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hmgxb3G3X9M3 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hmgxb3G3X9M3 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Hmgxb3G3X9M3 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms