Protein–RNA interactions for Protein: B7Z8K6

TRDC, T-cell receptor delta chain C region, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDCB7Z8K6 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRDCB7Z8K6 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRDCB7Z8K6 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRDCB7Z8K6 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRDCB7Z8K6 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRDCB7Z8K6 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRDCB7Z8K6 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRDCB7Z8K6 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRDCB7Z8K6 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRDCB7Z8K6 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRDCB7Z8K6 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRDCB7Z8K6 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TRDCB7Z8K6 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRDCB7Z8K6 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRDCB7Z8K6 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRDCB7Z8K6 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRDCB7Z8K6 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRDCB7Z8K6 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRDCB7Z8K6 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRDCB7Z8K6 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRDCB7Z8K6 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRDCB7Z8K6 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRDCB7Z8K6 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRDCB7Z8K6 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TRDCB7Z8K6 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TRDCB7Z8K6 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRDCB7Z8K6 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRDCB7Z8K6 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TRDCB7Z8K6 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRDCB7Z8K6 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRDCB7Z8K6 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRDCB7Z8K6 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRDCB7Z8K6 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRDCB7Z8K6 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRDCB7Z8K6 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRDCB7Z8K6 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRDCB7Z8K6 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TRDCB7Z8K6 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRDCB7Z8K6 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRDCB7Z8K6 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TRDCB7Z8K6 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRDCB7Z8K6 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRDCB7Z8K6 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRDCB7Z8K6 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TRDCB7Z8K6 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TRDCB7Z8K6 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRDCB7Z8K6 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRDCB7Z8K6 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRDCB7Z8K6 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRDCB7Z8K6 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRDCB7Z8K6 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRDCB7Z8K6 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRDCB7Z8K6 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRDCB7Z8K6 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRDCB7Z8K6 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRDCB7Z8K6 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRDCB7Z8K6 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRDCB7Z8K6 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRDCB7Z8K6 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRDCB7Z8K6 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRDCB7Z8K6 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRDCB7Z8K6 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TRDCB7Z8K6 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TRDCB7Z8K6 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRDCB7Z8K6 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRDCB7Z8K6 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRDCB7Z8K6 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRDCB7Z8K6 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRDCB7Z8K6 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRDCB7Z8K6 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRDCB7Z8K6 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRDCB7Z8K6 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRDCB7Z8K6 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRDCB7Z8K6 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRDCB7Z8K6 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRDCB7Z8K6 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRDCB7Z8K6 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRDCB7Z8K6 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRDCB7Z8K6 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TRDCB7Z8K6 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRDCB7Z8K6 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRDCB7Z8K6 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRDCB7Z8K6 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRDCB7Z8K6 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRDCB7Z8K6 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRDCB7Z8K6 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRDCB7Z8K6 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRDCB7Z8K6 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRDCB7Z8K6 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRDCB7Z8K6 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRDCB7Z8K6 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRDCB7Z8K6 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRDCB7Z8K6 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRDCB7Z8K6 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRDCB7Z8K6 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRDCB7Z8K6 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRDCB7Z8K6 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRDCB7Z8K6 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRDCB7Z8K6 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRDCB7Z8K6 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms