Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRAMEF22A3QJZ6 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRAMEF22A3QJZ6 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRAMEF22A3QJZ6 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRAMEF22A3QJZ6 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRAMEF22A3QJZ6 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRAMEF22A3QJZ6 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRAMEF22A3QJZ6 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PRAMEF22A3QJZ6 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PRAMEF22A3QJZ6 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRAMEF22A3QJZ6 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PRAMEF22A3QJZ6 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRAMEF22A3QJZ6 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRAMEF22A3QJZ6 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRAMEF22A3QJZ6 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRAMEF22A3QJZ6 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRAMEF22A3QJZ6 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRAMEF22A3QJZ6 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRAMEF22A3QJZ6 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRAMEF22A3QJZ6 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRAMEF22A3QJZ6 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRAMEF22A3QJZ6 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRAMEF22A3QJZ6 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRAMEF22A3QJZ6 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRAMEF22A3QJZ6 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PRAMEF22A3QJZ6 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRAMEF22A3QJZ6 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PRAMEF22A3QJZ6 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRAMEF22A3QJZ6 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PRAMEF22A3QJZ6 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRAMEF22A3QJZ6 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRAMEF22A3QJZ6 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRAMEF22A3QJZ6 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRAMEF22A3QJZ6 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PRAMEF22A3QJZ6 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRAMEF22A3QJZ6 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRAMEF22A3QJZ6 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRAMEF22A3QJZ6 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRAMEF22A3QJZ6 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRAMEF22A3QJZ6 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRAMEF22A3QJZ6 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRAMEF22A3QJZ6 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRAMEF22A3QJZ6 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRAMEF22A3QJZ6 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRAMEF22A3QJZ6 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRAMEF22A3QJZ6 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRAMEF22A3QJZ6 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRAMEF22A3QJZ6 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRAMEF22A3QJZ6 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRAMEF22A3QJZ6 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRAMEF22A3QJZ6 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRAMEF22A3QJZ6 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRAMEF22A3QJZ6 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRAMEF22A3QJZ6 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PRAMEF22A3QJZ6 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRAMEF22A3QJZ6 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRAMEF22A3QJZ6 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRAMEF22A3QJZ6 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRAMEF22A3QJZ6 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PRAMEF22A3QJZ6 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRAMEF22A3QJZ6 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRAMEF22A3QJZ6 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRAMEF22A3QJZ6 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PRAMEF22A3QJZ6 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRAMEF22A3QJZ6 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRAMEF22A3QJZ6 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRAMEF22A3QJZ6 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRAMEF22A3QJZ6 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRAMEF22A3QJZ6 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PRAMEF22A3QJZ6 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRAMEF22A3QJZ6 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRAMEF22A3QJZ6 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRAMEF22A3QJZ6 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRAMEF22A3QJZ6 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRAMEF22A3QJZ6 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRAMEF22A3QJZ6 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRAMEF22A3QJZ6 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRAMEF22A3QJZ6 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRAMEF22A3QJZ6 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRAMEF22A3QJZ6 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRAMEF22A3QJZ6 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRAMEF22A3QJZ6 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRAMEF22A3QJZ6 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRAMEF22A3QJZ6 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRAMEF22A3QJZ6 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRAMEF22A3QJZ6 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRAMEF22A3QJZ6 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PRAMEF22A3QJZ6 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRAMEF22A3QJZ6 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRAMEF22A3QJZ6 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRAMEF22A3QJZ6 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRAMEF22A3QJZ6 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRAMEF22A3QJZ6 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRAMEF22A3QJZ6 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRAMEF22A3QJZ6 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRAMEF22A3QJZ6 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRAMEF22A3QJZ6 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms