Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 MFSD8-245ENST00000641743 948 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 RCOR3-201ENST00000367005 4246 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 AC131971.1-201ENST00000332881 1482 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 CKAP5-202ENST00000354558 6428 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 ZNF181-203ENST00000459757 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 RIMS1-212ENST00000517827 3065 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 SCN11A-203ENST00000456224 5262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 AC009229.4-201ENST00000623854 1947 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 PRUNE2-201ENST00000223609 2697 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 PANDAR-201ENST00000629595 1506 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 CAST-207ENST00000395813 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 PRUNE2-208ENST00000443509 12356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 PCDH15-212ENST00000395442 2970 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 LINC01630-206ENST00000635103 4292 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 ABCB5-201ENST00000258738 2906 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 RNASE9-201ENST00000338904 1049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP28-201ENST00000363841 119 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 SNORA40.2-201ENST00000390847 128 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-1242P-201ENST00000391052 103 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 AL589647.1-201ENST00000402485 466 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 PRR21-201ENST00000408934 1170 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 RPL37P18-201ENST00000411602 243 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 LINC01507-201ENST00000417801 446 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 AL078590.2-202ENST00000422736 568 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 EI24P4-201ENST00000423683 1078 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 AC023469.2-201ENST00000425983 657 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 FABP7P2-201ENST00000429946 379 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 MTATP6P17-201ENST00000431030 672 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 AF127577.2-201ENST00000436429 824 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 AC018467.1-203ENST00000440785 506 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 ARL4AP3-201ENST00000441452 574 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 SDCBP-205ENST00000447267 772 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 AL592431.1-201ENST00000451090 317 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 AC004872.1-201ENST00000456062 469 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 AL137847.2-201ENST00000458111 527 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 SOX2-OT-207ENST00000476964 606 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 AC069444.1-201ENST00000489428 266 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 SLC9A9-AS2-201ENST00000490153 327 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 AC022133.1-201ENST00000490961 571 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 AC113347.4-201ENST00000506032 685 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 AC024132.2-201ENST00000506878 482 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 PRELID3BP5-201ENST00000508612 460 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 E2F5-204ENST00000517476 1094 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 AC022360.1-201ENST00000521058 340 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 AC092747.2-201ENST00000545069 983 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 LINC02294-201ENST00000549330 497 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 LINC01619-209ENST00000552277 571 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 RNASE9-206ENST00000554964 1101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 AL583810.3-201ENST00000555713 584 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 AC020659.1-204ENST00000562920 400 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 C15orf41-205ENST00000563167 772 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 AC007496.1-201ENST00000565641 739 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 MYLK-221ENST00000583087 678 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 AC097467.3-209ENST00000595760 615 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 AC068790.7-201ENST00000602347 528 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 AC113368.1-201ENST00000603736 382 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 AC009597.2-201ENST00000604659 592 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 AC011330.2-201ENST00000621680 635 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 AP000676.4-201ENST00000624659 623 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 LINC00976-202ENST00000628064 534 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 AC135068.12-201ENST00000637370 931 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 LINC01739-205ENST00000641890 573 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 EIF3M-208ENST00000531120 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 AL157756.1-201ENST00000532515 2859 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 ZNF445-201ENST00000396077 18299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 AL590399.5-201ENST00000428709 3325 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 RNMT-202ENST00000383314 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 SDCBP-213ENST00000630925 2076 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 LMNTD1-201ENST00000282881 1718 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 ERVW-1-201ENST00000493463 2925 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 EEF1A1-210ENST00000610520 3447 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 DAZ4-205ENST00000440066 1891 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 DAZ1-206ENST00000620725 1891 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 SLC25A46-208ENST00000513807 1546 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
TRAPPC9Q96Q05 GTF2H1-204ENST00000524753 1510 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
TRAPPC9Q96Q05 DPP10-204ENST00000409163 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
TRAPPC9Q96Q05 VCAM1-203ENST00000370115 2475 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
TRAPPC9Q96Q05 TCHHL1-201ENST00000368806 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
TRAPPC9Q96Q05 ZNF345-213ENST00000589046 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
TRAPPC9Q96Q05 SGIP1-204ENST00000371039 4080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
TRAPPC9Q96Q05 LTN1-202ENST00000389194 7749 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
TRAPPC9Q96Q05 PLCB1-210ENST00000612075 6576 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
TRAPPC9Q96Q05 ZNF382-204ENST00000439428 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
TRAPPC9Q96Q05 INPP4B-215ENST00000509777 4334 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
TRAPPC9Q96Q05 HTN1-201ENST00000246896 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
TRAPPC9Q96Q05 AC103591.2-201ENST00000265259 766 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TRAPPC9Q96Q05 RN7SKP104-201ENST00000362605 328 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TRAPPC9Q96Q05 RNU4-28P-201ENST00000364739 141 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP90-201ENST00000364801 99 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-619P-201ENST00000365146 108 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TRAPPC9Q96Q05 OR8V1P-201ENST00000395193 873 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TRAPPC9Q96Q05 SFR1P1-201ENST00000403720 688 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TRAPPC9Q96Q05 DNAJA1P4-201ENST00000406473 1166 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TRAPPC9Q96Q05 MIR1182-201ENST00000408363 97 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TRAPPC9Q96Q05 LURAP1L-AS1-201ENST00000417638 799 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
TRAPPC9Q96Q05 LINC01589-201ENST00000422971 548 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
TRAPPC9Q96Q05 AL590762.4-201ENST00000425885 253 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TRAPPC9Q96Q05 RPS26P47-201ENST00000427219 348 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TRAPPC9Q96Q05 ABCC13-201ENST00000429114 611 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
TRAPPC9Q96Q05 MOB1AP1-201ENST00000430903 535 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97 ms