Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 AL138785.1-201ENST00000425821 331 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
IMPG1Q17R60 COX6B1P7-201ENST00000430845 235 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
IMPG1Q17R60 AL161621.1-201ENST00000444796 340 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
IMPG1Q17R60 HMGB1P16-201ENST00000447155 540 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
IMPG1Q17R60 AP003774.2-202ENST00000449694 341 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
IMPG1Q17R60 LMOD2-201ENST00000456238 918 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
IMPG1Q17R60 AC231760.1-201ENST00000498002 260 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
IMPG1Q17R60 OR10J4-201ENST00000504970 935 ntAPPRIS P1 BASIC3.95□□□□□ -1.78
IMPG1Q17R60 AC093840.1-201ENST00000511599 336 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
IMPG1Q17R60 AC018797.3-201ENST00000513388 1241 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
IMPG1Q17R60 ZCCHC10-209ENST00000513541 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
IMPG1Q17R60 AC016598.2-201ENST00000514942 525 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
IMPG1Q17R60 NPM1P52-201ENST00000518264 846 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
IMPG1Q17R60 AL355432.1-201ENST00000522960 564 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
IMPG1Q17R60 AL451137.1-201ENST00000523363 443 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
IMPG1Q17R60 AL929601.2-201ENST00000549951 381 ntTSL 4 BASIC3.95□□□□□ -1.78
IMPG1Q17R60 AC137768.1-201ENST00000549998 553 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
IMPG1Q17R60 SNHG14-221ENST00000554726 1116 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
IMPG1Q17R60 AC068020.1-201ENST00000594215 661 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
IMPG1Q17R60 AC010680.3-201ENST00000604215 520 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
IMPG1Q17R60 AL139286.1-201ENST00000604465 483 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
IMPG1Q17R60 HMGB1P50-201ENST00000605814 607 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
IMPG1Q17R60 PCBP1-AS1-307ENST00000627050 912 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
IMPG1Q17R60 ZNF594-201ENST00000399604 4862 ntAPPRIS P1 BASIC3.95□□□□□ -1.78
IMPG1Q17R60 FAM126B-202ENST00000418596 9333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
IMPG1Q17R60 KCNT2-202ENST00000367433 5883 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
IMPG1Q17R60 RGPD4-201ENST00000408999 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
IMPG1Q17R60 FAM111B-202ENST00000411426 3344 ntTSL 4 BASIC3.95□□□□□ -1.78
IMPG1Q17R60 LTN1-207ENST00000614971 7756 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
IMPG1Q17R60 WDR72-204ENST00000559418 3602 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
IMPG1Q17R60 DGKH-201ENST00000261491 17261 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
IMPG1Q17R60 ZNF616-201ENST00000330123 2563 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
IMPG1Q17R60 AC092650.1-201ENST00000447571 1808 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
IMPG1Q17R60 AC139713.2-214ENST00000642059 1811 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
IMPG1Q17R60 LINC01566-202ENST00000569242 2801 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
IMPG1Q17R60 FAM3C2-201ENST00000312214 681 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
IMPG1Q17R60 RNU1-132P-201ENST00000364300 164 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
IMPG1Q17R60 RNU6-225P-201ENST00000384613 103 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
IMPG1Q17R60 MIR1251-201ENST00000408552 70 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
IMPG1Q17R60 AC118345.1-201ENST00000411785 366 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
IMPG1Q17R60 AC003975.1-201ENST00000411856 837 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
IMPG1Q17R60 AL590006.1-201ENST00000417390 752 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
IMPG1Q17R60 AC073464.3-201ENST00000422564 712 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
IMPG1Q17R60 AC234779.1-201ENST00000425910 285 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
IMPG1Q17R60 TAF1A-AS1-202ENST00000427540 750 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
IMPG1Q17R60 MTCO1P54-201ENST00000430139 712 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
IMPG1Q17R60 AC087650.1-201ENST00000431445 468 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
IMPG1Q17R60 AC096638.2-201ENST00000434965 711 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
IMPG1Q17R60 AP000943.1-201ENST00000438416 712 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
IMPG1Q17R60 CBX1P1-201ENST00000440184 427 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
IMPG1Q17R60 BMS1P22-202ENST00000440946 1160 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
IMPG1Q17R60 AC006011.1-201ENST00000442758 349 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
IMPG1Q17R60 AC010975.1-201ENST00000443301 669 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
IMPG1Q17R60 LINC01645-201ENST00000451341 491 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
IMPG1Q17R60 AL137005.1-201ENST00000452944 719 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
IMPG1Q17R60 AL645939.1-201ENST00000453429 797 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
IMPG1Q17R60 AC069277.2-201ENST00000454211 432 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
IMPG1Q17R60 AC025566.1-201ENST00000477153 490 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
IMPG1Q17R60 AC007686.1-201ENST00000488511 463 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
IMPG1Q17R60 AC093824.1-201ENST00000508796 343 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
IMPG1Q17R60 AC010451.2-201ENST00000511514 545 ntTSL 4 BASIC3.94□□□□□ -1.78
IMPG1Q17R60 AL163973.3-201ENST00000547093 430 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
IMPG1Q17R60 LINC02386-202ENST00000551287 564 ntTSL 4 BASIC3.94□□□□□ -1.78
IMPG1Q17R60 AC068831.4-201ENST00000556118 109 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
IMPG1Q17R60 PSMB7P1-201ENST00000556349 514 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
IMPG1Q17R60 AC007599.1-201ENST00000568688 1174 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
IMPG1Q17R60 AC025627.2-201ENST00000576220 160 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
IMPG1Q17R60 AC068408.2-201ENST00000584566 439 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
IMPG1Q17R60 AL157938.2-204ENST00000589667 826 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
IMPG1Q17R60 SNX6P1-201ENST00000601728 1224 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
IMPG1Q17R60 AC026368.1-201ENST00000614934 690 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
IMPG1Q17R60 C6orf10-209ENST00000612031 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
IMPG1Q17R60 UGT8-202ENST00000394511 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
IMPG1Q17R60 LINC01239-202ENST00000436786 2347 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
IMPG1Q17R60 NME8-203ENST00000440017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
IMPG1Q17R60 GALNT13-202ENST00000409237 2591 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
IMPG1Q17R60 LINC02232-201ENST00000509932 4079 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
IMPG1Q17R60 POPDC3-201ENST00000254765 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
IMPG1Q17R60 CKAP5-201ENST00000312055 6532 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
IMPG1Q17R60 WNK3-205ENST00000620763 5400 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
IMPG1Q17R60 AL031985.3-201ENST00000565390 2449 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
IMPG1Q17R60 RNF38-210ENST00000611646 5185 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
IMPG1Q17R60 CYP3A7-CYP3A51P-201ENST00000611620 1608 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
IMPG1Q17R60 SLITRK4-203ENST00000596188 8545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
IMPG1Q17R60 AC103591.2-201ENST00000265259 766 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
IMPG1Q17R60 HNMT-201ENST00000280096 504 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
IMPG1Q17R60 SNORA60-201ENST00000362396 134 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
IMPG1Q17R60 RNA5SP509-201ENST00000364577 119 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
IMPG1Q17R60 RNU6-304P-201ENST00000364855 107 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
IMPG1Q17R60 IGKV5-2-201ENST00000390244 408 ntAPPRIS P1 BASIC3.93□□□□□ -1.78
IMPG1Q17R60 ELOCP19-201ENST00000411919 318 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
IMPG1Q17R60 AC073069.1-201ENST00000428657 441 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
IMPG1Q17R60 RPL7P31-201ENST00000450192 724 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
IMPG1Q17R60 FCF1P7-201ENST00000451185 558 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
IMPG1Q17R60 AC068707.1-201ENST00000451438 391 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
IMPG1Q17R60 RPL7P1-201ENST00000468161 747 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
IMPG1Q17R60 RPL7P9-201ENST00000468715 747 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
IMPG1Q17R60 AC011276.1-201ENST00000469688 323 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
IMPG1Q17R60 RN7SL303P-201ENST00000469773 251 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
IMPG1Q17R60 RN7SL271P-201ENST00000487601 295 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.8 ms